番茄组蛋白去乙酰化酶hd2 家族生物信息学及表达 - 广东农业科学.pdf

138 广东农业科学 2014 年第 12 期 番 组蛋白去乙酰化酶HD2 家族生物 信息学及表达模式分析 1,2 1 1 卢晶霞 杨松光 吴克强 1.中国科学院华南植物 /中国科学院植物资源保护与可持续利用重点实验室袁广东 广州 510650 曰 2.中国科学院大学袁北京 100049冤 摘要 在生物信息学分析和克隆番茄组蛋白去乙酰化酶 HD2 亚家族的基础上袁探究了 HD2 家族在番茄果实 发育阶段的表达模式遥 结果显示袁番茄 HD2 家族有 3 个成员袁其氨基酸序 N 端具有典型的 MEFWG 五肽基序袁中部 为疏水结构域分隔开的两段富含酸性氨基酸的结构域袁C 端的序列呈多样性袁并且具有 C2H2 型锌指结构曰亚细胞定 位预测发现该家族成员均定位于细胞核袁这与其参与组蛋白修饰功能相一致遥 表达模式结果显示袁HD2 基因家族在 果实发育阶段中具有阶段特异性袁推测其在调控番茄的果实发育方面有重要作用遥 关键词 组蛋白去乙酰化曰 生物信息学分析曰 表达模式曰 组蛋白修饰 中图分类号 Q786 文献标识码 A 文章编号 1004-874X 2014冤12-0138-06 Bioinformatics and expression pattern analysis of Histone deacetylase HD2 subfamily in tomato (Solanum lycopersicum) 1,2 1 1 LU Jing-xia , YANG Song-guang , WU Ke-qiang (1.South China Botanical G arde n/Key Laboratory of Plant Re sourc es Conse rv ation and Suitable Utilization, Chine se A cade my of Sc ie nc es , G uangz hou 510650, China; 2.Univ e rs ity of Chinese A c ade my of Sc ie nce s , Be ij ing 100049, China) A bstract 院Histone acetylation plays a key role in regulating chromatin organization and gene expression. In this study, we successfully identified and cloned three tomato HD2 genes, SlH DT1101, SlH DT1102 and SlH DT1103. A ll the three tomato HD2 proteins had a characteristic domain structure要a conserved pentapeptide motif (MEFW G) on the N-terminal and two highly charged acidic stretches in the c