高通量测序服务 - 赛百盛
高通量测序服务
I. 16S多样性测序
环境微生物群落多样性分析,传统的方法是用16S
PCR产物连接T载体,挑取单克隆的方法来完成。随着对多样性分析的需求日益
增加,传统的方法已经越来越不能满足研究所需了,本公司现推出基于Miseq
测序平台的环境微生物多样性分析。Miseq平台的测序读数长、通量大的优势,
可以为研究者得到更完美的数据。目前,美国Earth Microbiome
Project 已将该方法作为16S
rDNA测序与环境群落结构多样性研究的标准方法,已有多名权威学者的研究成
果在ISME J[1] 、Cell[2]、Nature[4]等顶尖期刊上发表。
生物信息分析
1. 数据统计分析
2. 数据根据Barcode信息回归样品
3. OTU (Operational Taxonomic Units )聚类
4. 稀释性曲线(Rarefaction Curve )
5. 分类学分析(Silva数据库)
6. 菌群多样性、丰度和测序深度指数计算
7. 多样品间两两sharedchao、sharedace指数计算
8. 组间显著性差异分析
9.
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