澄黄滨珊瑚和丛生盔型珊瑚非培养放线菌多样性 - 微生物所期刊联合 .PDFVIP

微生物学通报 Apr. 20, 2014, 41(4): 691−698 Microbiology China © 2014 by Institute of Microbiology, CAS tongbao@ DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130230 简 报 澄黄滨珊瑚和丛生盔型珊瑚非培养放线菌多样性 1,2 1 1 1 1* 陈淇 龙丽娟 张偲 董俊德 李洁 (1. 510301) (2. 100049) 摘 要【目的】研究澄黄滨珊瑚(Porites lutea)和丛生盔型珊瑚(Galaxea fascicularis)联合放线 菌物种多样性。【方法】实验提取两种珊瑚的总DNA ，利用放线菌特异性引物对样品总 DNA 进行扩增，通过构建 16S rRNA 基因克隆文库和系统发育分析，对三亚鹿回头岸礁区优势物种 澄黄滨珊瑚和丛生盔型珊瑚联合放线菌的多样性和群落结构进行研究。【结果】118 个从澄黄滨 珊瑚克隆文库中随机挑选的阳性克隆子归为58 个OTUs ，主要分布于酸微菌亚目、棒状杆菌亚 目、微球菌亚目、丙酸杆菌亚目和未知类群。丛生盔型珊瑚克隆文库共获得96 个序列，归为 31 个OTUs ，主要分布于酸微菌亚目和未知的放线菌类群。多样性指数和稀疏度曲线分析结果 显示澄黄滨珊瑚联合放线菌物种多样性比丛生盔型珊瑚更高。【结论】澄黄滨珊瑚和丛生盔型 珊瑚拥有较高水平的放线菌物种多样性和复杂的群落结构，并隐藏着大量的高等级放线菌新分 类单元。 关键词造礁珊瑚，放线菌，免培养，群落结构 Diversity of actinobacteria associated with coral Porites lutea and Galaxea fascicularis CHEN Qi1,2 LONG Li-Juan 1 ZHANG Si 1 DONG Jun-De 1 LI Jie1* (1. Key Laboratory of Tropical Marine Bio-resources and Ecology , South China Sea Institute of Oceanology, Chinese Academy Sciences, Guangzhou, Guangdong 510301, China) (2. University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China) Abstract: [Objective] The aim of this study was to uncover the diversity of actinobacteria associated with corals Porites lutea and Galaxea fascicularis. [Methods] Total DNA of coral samples was extracted for PCR amplification with the primers of class actinobacteria. Two clone libraries were co