20160819 外泌体这周有什么研究新进展?.docVIP

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20160819 外泌体这周有什么研究新进展?

外泌体这周有什么研究新进展? 原创?2016-08-19?小诺 欢迎关注我们的每周外泌体研究进展盘点,往期回顾可回复“外泌体”进行查看,也可回复献+邮箱”索取文献原文。 那么,这周,外泌体的研究又有了怎样的成果发表出来?我们一起来看看吧。 外泌体本周研究新进展 01牛胎儿血清RNA干扰细胞培养基来源的胞外RNA? Fetal Bovine Serum RNA Interferes with the Cell Culture derived Extracellular RNA? 期刊:Scientific reports? 影响因子:5.228? 作者单位: 哈佛医学院 文献简介 在过去的数十年来,牛胎儿血清(FBS)一直被用于真核细胞培养。但是,很少人注意到FBS的RNA内含物对细胞培养的生物学影响。在这篇文章中,研究者使用RNA测序,证实了FBS含有丰富的蛋白编码作用和调控作用的RNA种类,包括mRNA、miRNA、rRNA和snoRNA。在胞外囊泡(EV)和胞间通讯的研究中,通常都会使用无囊泡的FBS(vesicle-depleted FBS, vdFBS),避免来自FBS的囊泡对EV产生污染,所以用于细胞培养的FBS,会先经过超速离心,去除其本身的囊泡,才能用于EV研究。而研究者RNA测序获得的FBS RNA图谱的大部分(70%)甚至在超速离心之后仍保留在vdFBS中 !FBS相关的RNA会和细胞培养基来源的胞外RNA (exRNA)和一起被提取出来,干扰下游RNA分析。 许多进化上保守的FBS来源的RNA种类都会被错误地注释为人类或小鼠的转录本,尤其是在FBS中丰度很高的特异miRNA,如miR-122、miR-451a和miR-1246,已被报道富集于细胞培养基来源的EV,很可能是被FBS造成混淆的结果。公开的exRNA数据库分析也支持FBS污染这个猜测。除此以外,FBS转录本还可以被培养的细胞吸收,影响高敏感性基因表达图谱技术(如二代测序)的结果。因此,在实验设计的注意事项方面,有必要重视FBS来源的RNA造成的干扰和误解,将它带来的影响最小化。 小诺看法 文章中提出的这个问题,还是十分严峻的,所以特地向大家介绍这篇文章。除了很个别的EV研究能完全无血清培养细胞,提取EV,其余大部分还是需要使用血清的。这篇文章的数据已经很清晰了,研究者能在10% FBS培养的小鼠细胞中检测到只有牛、人、猩猩和黑猩猩中表达的miR-1246,让人无法忽略这个问题。? 研究者还提出,基于细胞培养的exRNA研究的影响因素有几个:培养基组分,包括血清,生长因子和其他天然衍生物;FBS/培养基预处理步骤不同,去除RNA的效果也不同,研究者给出了一个较高效的延长版超离方法;最后,即使在相同的实验条件下,FBS和培养基的品牌和批次也会有不一样的混杂因素。这么说来,研究者们可能需要设置不同的control来减少以上因素对实验的影响了,比如采用相同步骤从相对应的新鲜培养基提取的RNA样本。 02 PGE2/EP4信号通路通过胞外囊泡内的脂筏调控乳腺干细胞状态的转变? PGE2/EP4 signaling controls the transfer of the mammary stem cell state by lipid rafts in extracellular vesicles? 期刊:stem cells? 影响因子:5.902? 作者单位:台湾健康研究所 文献简介 前列腺素E2(PGE2)发起的信号通路有助于干细胞内稳态和再生,但是还不清楚它的信号是怎样调控细胞多能性的。这篇文章中,鉴定了一个之前未知的机制:PEG2/前列腺素E受体4 (EP4)信号通路调控着多个信号通路(如PI3K/Akt信号、TGFβ信号、Wnt信号、EGFR信号),维持基底乳腺干细胞(basal mammary stem cell)表型。 基底乳腺上皮干细胞(MaSC)从间叶细胞/干细胞状态向非基底型MaSC状态的转化,发生在应答EP4拮抗剂的时候。EP4拮抗剂会引起信号通路元件的释放,以脂筏/caveolae依赖的方式控制它们转运到胞外囊泡(EV)/exo中;通过诱导EV/exo释放,EP4拮抗剂间接使需要乳腺上皮干细胞内稳态的通路失活,如典型和非典型的Wnt、TGFβ和PI3K/Akt通路。EP4拮抗剂引起信号受体和信号元件从非脂筏组分转变为脂筏组分,然后释放到EP4拮抗剂诱导的EV/exo,使干细胞状态减少。相反,腔内的乳腺上皮细胞可以获得基底的干细胞特性,然后吸收EP4拮抗剂诱导的干细胞EV/exo,然后形成乳腺。 这项发现,证实了PGE2/EP4信号通过调控EV/exo释放,控制乳腺上皮干细胞的内稳态。通过含

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