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分子标记(Molecular marker)
分子标记(Molecular marker)
分子标记
[编辑本段]【分子标记的概念】
分子标记是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是DNA水平遗传多态性的直接的反映。与其他几种遗传标记--形态学标记、生物化学标记、细胞学标记相比,DNA分子标记具有的优越性有:大多数分子标记为共显性,对隐性的性状的选择十分便利;基因组变异极其丰富,分子标记的数量几乎是无限的;在生物发育的不同阶段,不同组织的DNA都可用于标记分析;分子标记揭示来自DNA的变异;表现为中性,不影响目标性状的表达,与不良性状无连锁;检测手段简单、迅速。随着分子生物学技术的发展,现在DNA分子标记技术已有数十种,广泛应用于遗传育种、基因组作图、基因定位、物种亲缘关系鉴别、基因库构建、基因克隆等方面。
分子标记的概念有广义和狭义之分。广义的分子标记是指可遗传的并可检测的DNA序列或蛋白质片段狭义分子标记是指能反映生物个体或种群间基因组中某种差异的特异性DNA。
理想的分子标记必须达以下几个要求:(1)具有高的多态性;(2)共显性遗传,即利用分子标记可鉴别二倍体中杂合和纯合基因型;(3)能明确辨别等位基因;(4)遍布整个基因组;(5)除特殊位点的标记外,要求分子标记均匀分布于整个基因组;(6)选择中性(即无基因多效性);(7)检测手段简单、快速(如实验程序易自动化);(8)开发成本和使用成本尽量低廉;(9)在实验室内和实验室间重复性好(便于数据交换)。但是,目前发现的任何一种分子标记均不能满足以上所有要求。
[编辑本段]【分子标记的种类】
一、基于分子杂交技术的分子标记技术
此类标记技术是利用限制性内切酶解及凝胶电泳分离不同的生物分子然后用经标记的特异DNA,DNA探针与之进行杂交,通过放射自显影或非同位素显色技术来揭示DNA的多态性。
①限制性片段长度多态性(限制性片段长度多态性,限制性片段长度多态性)
1974年grodzicker等创立了限制性片段长度多态性(RFLP)技术,它是一种以DNA-DNA杂交为基础的第一代遗传标记。RFLP基本原理:利用特定的限制性内切酶识别并切割不同生物个体的基因组得到大小不等的DNA,DNA片段,所产生的DNA数目和各个片段的长度反映了DNA分子上不同酶切位点的分布情况。通过凝胶电泳分析这些片段,就形成不同带,然后与克隆DNA探针进行南杂交和放射显影,即获得反映个体特异性的RFLP图谱。
It stands for genomic DNA, which produces differences in length after restriction digestion. Because of the change of base substitution, rearrangement and deletion among alleles of different individuals, restriction endonuclease recognition and enzyme digestion change, resulting in the difference of restriction fragment length between genotypes.
The allele of RFLP has the characteristics of CO dominant. The number of RFLP marker loci is unrestricted, and the number of loci usually detected is 1 - 4. RFLP technology also has some defects. It is difficult to clone the probes that can express genomic DNA polymorphism. In addition, the experimental operations are more complicated, the detection cycle is long, and the cost is very high. Since the advent of RFLP, it has been widely used in gene localization and typing, genetic linkage map construction, gene diagnosis of disease, and so on.
Variable VNTR, Number, of, Tandem, Repeats)
A variable number of tandem repeats, also
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