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聚苹果酸生产菌株出芽短梗霉菌代谢组学样品前处理方法的优化
生物技术通报
·技术与方法· BIOTECHNOLOGY BULLETIN ( )
2016, 32 6 :54-59
聚苹果酸生产菌株出芽短梗霉菌代谢组学样品前处理
方法的优化
1 1 3,4 1,2
范栩嘉 边艳慧 殷海松 乔长晟
(1. 天津科技大学生物工程学院 工业发酵微生物教育部重点实验室,天津 300457;2. 天津北洋百川生物技术有限公司,天津 300457;
3. 天津现代职业技术学院生物工程学院,天津 300350;4. 天津市轻工业化学研究所有限公司,天津 300350)
摘 要 : 为了得到更加准确和完整的胞内代谢物信息,从而更加真实的反映微生物胞内代谢情况,基于GC-MS平台,从淬
灭剂、提取剂和溶解剂3个方面对代谢组学样品制备过程进行了系统性的优化。对比了不同淬灭剂对胞内代谢物的渗出及细胞损
伤情况,结果表明60% 甲醇/0.9% NaCl效果最佳。研究了不同提取剂、溶解剂的提取和溶解效果,结果显示60% 甲醇提取效果显
著,吡啶溶解效果突出。最终确定了出芽短梗霉菌代谢组样品最适前处理方法 :预冷的60% 甲醇/0.9% NaCl淬灭细胞,液氮研磨
和反复冻融破碎细胞,预冷的60% 甲醇提取,最后采用吡啶溶解提取物并采用MSTFA 40℃衍生90 min。采用该方法可以检测出
300 多种代谢组分,包括大量氨基酸、有机酸和糖类物质。本方法可以有效的应用于出芽短梗霉菌代谢组学样品的研究。
关键词 : 代谢组学 ;出芽短梗霉;GC-MS;样品前处理
DOI:10.13560/ki.biotech.bull.1985.2016.06.009
Optimization of Sample Pretreatment Method for Metabolomics
Studies of Aureobasidium pullulans Producing Polymalic Acid
1 1 3,4 1,2
FAN Xu-jia BIAN Yan-hui YIN Hai-song QIAO Chang-sheng
(1. Key Laboratory of Industrial Microbiology of Ministry of Education ,College of Biotechnology ,Tianjin University of Science and
Technology ,Tianjin 300457 ;2. Tianjin Peiyang Biotrans Biotech Co. ,Ltd ,Tianjin 300457 ;3. School of Biotechnology ,Tianjin Modern
Vocational Technology College ,Tianjin 300350 ;4. Tianjin Research Institute of Light Industrial Chemistry ,Tianjin 300350 )
Abstract: In order to acquire more accurate and complete intracellular metabolite information,and therefore to more realistically
re
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