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沙田柚GDSL酯酶脂肪酶基因的鉴定及序列分析
江苏农业科学 2017年第45卷第11期 — 45—
刘玉洁,郭丹妮,张 渝,等.沙田柚GDSL酯酶/脂肪酶基因的鉴定及序列分析[J].江苏农业科学,2017,45(11):45-48.
doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2017.11.012
沙田柚 GDSL酯酶/脂肪酶基因的鉴定及序列分析
刘玉洁,郭丹妮,张 渝,覃信梅,李惠敏,秦新民
(广西师范大学生命科学学院/珍稀濒危动植物生态与环境保护教育部重点实验室,广西桂林541004)
摘要:利用高通量测序技术对沙田柚自交和异交花柱进行转录组测序。通过差异分析得到GDSL酯酶/脂肪酶的
基因序列,该基因全长1306bp(GenBank登录号:KU159279),开放阅读框(简称ORF)全长1104bp,共编码367个氨
基酸,编码的蛋白质分子量为40.09ku,理论等电点为6.44,含有 1个与 SGNH蛋白相同的保守结构域(conserved
activesites,简称CAS);GDSL基因在沙田柚自交1d花柱中的表达量(简称RPKM)为4.68,2d为2.41,3d则迅速下
降到0.27;在异交1d花柱中该基因的表达量为4.48,2d迅速升高至7.43,3d仍维持较高水平为4.37;系统进化树
显示,沙田柚GDSL酯酶/脂肪酶基因与甜橙(Citrussinensis)亲缘关系很近,属于同一进化分支。
关键词:沙田柚;GDSL酯酶/脂肪酶基因;序列分析;鉴定
中图分类号:S666.301 文献标志码:A 文章编号:1002-1302(2017)11-0045-04
植物自交不亲和是指具有完全花且能够产生雌雄配子, 而得名,其中,G、D、S分别代表甘氨酸、天冬氨酸、丝氨酸。
雌蕊的柱头或花柱能特异性识别与自体基因型相同的花粉, 目前,尚未见GDSL酯酶/脂肪酶基因与植物授粉和自交不亲
[1]
导致花粉不萌发或花粉管停止生长的一种现象 。在高等 和性相关的研究报道。笔者对沙田柚自交和异交花柱进行转
植物中,据估计有超过一半的显花植物表现出自交不亲和性, 录组测序,通过对所测的Unigenes功能进行注释,获得了沙
[2]
这种现象在被子植物中尤其明显 。自交不亲和对植物保 田柚GDSL酯酶/脂肪酶基因,对该基因编码蛋白质的理化特
持遗传多样性以及杂种优势有着极其重要的作用。 征、在沙田柚自交与异交花柱中的表达进行了分析,旨在为深
目前,植物自交不亲和性的研究取得了较大进展。在茄 入研究GDSL酯酶/脂肪酶基因的生理功能以及沙田柚自交
科、车前草科、罂粟科,自交不亲和物种利用胞外核糖核酸酶 不亲和的分子机制提供依据。
[3]
(简称S-RNase)阻止花粉管的生长 。在蔷薇科、玄参科
1 材料与方法
中,自交不亲和现象受 S位点相关的F-box基因SLF的调
[4]
控,这些基因能在花粉中特异性表达 。此外,一些基因也 1.1 试验材料
参与了植物自交不亲和反应,如参与防御的蛋白质可能在花 沙田柚试验材料取自广西壮族自治区桂林市灵川县潮田
粉萌发以及花粉管延伸到生长停止、破裂等一系列过程中发 乡大山口村果园10年生结果树。取盛花期人工自交授粉
[5]
挥作用 。Distefano等发现与花粉特异性识别以及花粉管定 (沙田柚×沙田柚)和异交授粉(酸柚×沙田柚)后 1~3d的
[6]
向生长有关的蛋白表现出多样化特性 。钙离子在调节花
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