元基因组学及其在转化医学中的应用.pdfVIP

选锘Hereditas(Beijing)2015年7,EJ，37(7)：645—654 www．chinagene．cn 综述 元基因组学及其在转化医学中的应用 陈嘉焕，孙政，王晓君，苏晓泉，宁康 中国科学院青岛生物能源与过程研究所，青岛266101 摘要：微生物群落遍布于人体的每个角落，与人共生并对人体健康产生重要和深刻的影响。与人类共生的全部 微生物的基因组总和称为“元基因组”或“人类第二基因组”。研究人体微生物群落及相关元基因组数据，对转化 医学领域的基础研究和临床应用具有重要的价值。通过对生物医学相关的高通量元基因组数据进行分析，不仅 能为基础医学研究向医学临床应用转化提供新思路和新方法，而且具有广阔的应用前景。基于新一代测序技术 产生的数据，元基因组分析技术和方法能够弥补以往人体微生物先培养后鉴定方法的缺陷，同时能有效鉴定和 分析微生物群落的组成及功能，从而进一步探究和揭示微生物群落与机体生理状态之间的关系，为解决许多医 学领域的难题提供了全新的切入角度和思维方法。文章系统介绍了元基因组研究的现状，包括元基因组的方法 概念和研究进展，并以元基因组在医学研究中的应用为着眼点，综述了元基因组在转化医学方面的研究进展， 进一步阐述了元基因组研究在转化医学应用领域中具有的重要地位。 关键词：转化医学；人体微生物群落；元基因组 Researchin andits intranslationalmedicine metagenomicsapplications Jiahuan Chen，ZhengSun，XiaojunWang，XiaoquanNing Su，Kang Institute and Qingdao ofBioenergyBioprocessTechnology,Chinese 266101，China AcademyofSciences，Qingdao Abstract：Humansarebornwith have US our isanim． microbiota，whichaccompaniedthrough life．span．There betweenUSandthemicrobial microbialcommunitiesareof portantsymbioticrelationship communities，thus great toourhealth．All informationwithinthismicrobiotaisrefereredto importance genomic as‘‘metagenomics’’(also referredtoas“human’Ssecond of data frombio— genome”、．The analysishighthroughputmetagenomicgenerated medical would new for translational ithaveseveral experimentsprovideapproaches research，and applications inclinics．Withthe ofnext andthe help generationsequencingtechnologyemerging