生物信息技术加速开发旧药新用途及创新方案.PDFVIP

生物化学与生物物理进展 Progress in Biochemistry and Biop hys ics 2012, 39(1): 35~44 物信息技术加速开发旧药新用途* 1, 2) 2) 2) 2) 2)** 2)** 黄宏斌 梁 芳 熊 炜 李小玲 曾朝阳 李桂源 1) 2) ( 国防科技大学信息系统工程重点实验室，长沙4 10073； 中南大学肿瘤研究所癌变与侵袭原理教育部重点实验室，长沙4 10078) 摘要 传统的技术路线研发新药，不仅周期很长而且耗资巨大，开发已获批准药物新的治疗用途，又称为药物重定位，比传 统的新药研发具有明显的优势 基于芯片的基因表达谱分析，已常规地广泛用于各种人类疾病的临床研究，提供了在全基因 组水平描述疾病状态的特征信号 同时，基因芯片也广泛地用于对比药物处理前后细胞基因表达模式的变化，这也提供了反 映药物效应的高质量信号 最近出版的Science Trans lational Medic ine 杂志同时发表了一个研究组的两篇论文，为我们展示了 如何利用生物信息学手段重新解析和比较全基因组基因表达谱数据，以高效地预测药物的新用途 这两篇论文使用了公共数 据库中的100 种疾病基因表达谱数据，以及164 种药物处理前后细胞基因表达谱数据，通过比较和配对疾病与药物基因表达 谱，得到了一些可以逆转疾病异常表达基因的药物，其中证实了一些已知的药物- 疾病组合，也预测了一些新的药物- 疾病 组合 最后通过实验验证了抗溃疡药可用于治疗肺癌，而抗癫痫药可治疗炎症性肠道疾病，进一步证实了他们所采用研究策 略的正确性 于是，肺癌和炎性肠道疾病这两种临床上难治的疾病有了新的候选治疗药物，我们也有了一种挖掘已有数据快 速发现药物新用途的思路和方法 关键词 生物信息学，基因表达谱，药物重定位 学科分类号 Q61 DOI: 10.3724/SP.J.1206.201 1.00453 传统的技术路线研发新药，不仅周期很长而且 年代，万艾可上市时原本用于治疗冠心病和心绞 耗资巨大 有统计表明，一个新药从研发到上市， 痛，后来却偶然地发现它对勃起功能障碍(erectile [1] 大约需要15 年，花费超过10 亿美元 ，其中相当 dysfunction，ED)具有显著的疗效 由于这一新用 大的一部分研发费用花在了新药的早期筛选和毒性 途的发现，2003 年辉瑞公司的销售额达到18.8 亿 实验中，大约有 90% 的候选分子因不能通过早 美元，仅美 就有近800 万男性服用过万艾可[4] 期实验和毒性评估而终止 因此，深入研究已获 另一个非常有戏剧性的例子是沙利度胺 批准的药物，充分发掘已有药物的新用途(drug (thalidomide) 该药最早于1957 年在德 和英 上 repurposing) [2] ，或者说对药物进行重定位(drug 市，起初作为镇静剂用于治疗失眠和恶心，特别是 repositioning)[3] ，一直受到生物医药产业的广泛重 用于缓和孕妇的妊娠反应( 因此该药还有一个别名 因为批准上市的药物已经历了数期临床试验， 叫“反应停”) ，到 1961 年时，沙利度胺已在46 其毒副作用已经通过了严格的评估，安全性有保 障，因此，这些药物的新用途更容易获得药品监管 部门的批准，从而可大大降低研发风险，缩减研发 * 家自然科学基金资助项目(3087 1282, 81172 189, 费用，节省研发时间，尽早应用于临床，开拓新的 , 湖南省自然科学基金资助项目(10JJ7003), 霍英东高校青 年教师基金资助项目(