急性腹泻患儿诺如病毒检测及分型.docVIP

急性腹泻患儿诺如病毒检测及分型[摘要] 目的 了解苏州地区急性腹泻患儿诺如病毒的分子特征和基因型别。方法 收集苏州地区2009年9月～2010年3月共153份5岁以下急性腹泻患儿粪便或肛拭标本，用多重RT-PCR方法检测诺如病毒，选择部分阳性扩增片段进行基因序列测定，并对序列进行系统进化分析。结果 急性腹泻患儿诺如病毒检出率为16.34%（25/153），均为诺如病毒Ⅱ型，且诺如病毒基因型别均为GⅡ-4/2006b变异株。结论 诺如病毒是2009～2010年引起苏州地区急性腹泻患儿重要的病原之一，诺如病毒GⅡ-4/2006b变异株或类似株可能是2009～2010年苏州地区流行的优势株。 [关键词] 诺如病毒；分子特征；基因型别 [中图分类号] R725.1 [文献标识码] B [文章编号] 1673-9701（2011）31-84-02 Detection and Typing of Norovirus of Acute Diarrhea in Suzhou Area, 2009-2010 XUE Hua1 ZHAI Juping2 1.Jinchang District Center for Disease Prevention and Control, Suzhou 215008, China; 2.Department of Clinical Laboratory, the First Affiliated Hospital of Soochow University, Suzhou 215006, China [Abstract] Objective To investigate the molecular characteristics and genotypes of human Norovirus (NV) in acute diarrhea in Suzhou. Methods Fecal specimens were collected from children (＜5 years) with acute diarrhea. Norovirus of 153 specimens were detected by multiplex RT-PCR. PCR products of several positive samples were randomly selected and sequenced. The sequences were analyzed by phylogenetic analysis. Results Twenty-five Norovirus positive cases were detected in 153 facal specimens (16.34%), 25 isolates were Norovirus Ⅱ-types. Conclusion Norovirus is one of the major pathogens causing acute diarrhea of children, and GⅡ-4/2006b variant and like strains are probably identified as the prevalent strain from 2009 to 2010 in Suzhou, Jiangsu Province. [Key words] Norovirus; Molecular characteristics; Genotype 诺如病毒（Norovirus，NV）属于人类杯状病毒（human calicivirus，HuCV）科，是引起人类急性病毒性胃肠炎的主要病原体之一，是仅次于轮状病毒引起的婴幼儿急性腹泻的常见病原[1，2]。诺如病毒可通过被污染的水源、食物和人与人之间的接触等多种途径进行传播，少量病毒即可引起感染，常在幼儿园、学校、餐馆、军队、医院、家庭和其他人群中引起暴发和流行[3，4]。为了解和掌握苏州地区诺如病毒的流行情况，我们于2009年9月～2010年3月采集了153份急性腹泻患儿的粪便标本，并进行诺如病毒的检测和分型研究。 1 材料与方法 1.1 标本收集 收集苏州地区2009年9月～2010年3月共153份5岁以下急性腹泻患儿粪便或肛拭标本。 1.2 核酸提取 应用PBS溶液将粪便标本制备成10%悬液，室温静止10min，室温8000rpm离心5min，离心后取200μL上清，采用德国Qiagen公司QIAamp Viral RNA提取病毒核酸，按照试剂盒操作说明书进行，收集终体积为50μL核酸提取液备用。 1.3