PHYP与PHYB光感受区.docVIP

PHYP与PHYB光感受区 同义替换速率（ｄＳ）或非同义替换的速率（ｄＮ）是一年中或一个世代内一个同义位点上发生同义替换的数目或一个非同义位点上发生非同义替换的数目。实际上，由于不知道２个序列的分歧时间，因此，习惯上总是考虑一对序列的平均每个同义位点上发生同义替换的数目或平均每个非同义位点上发生非同义替换的数目。ｄＳ等于ｄＮ时（即omega;＝１），表明没受到自然选择；ｄＳ大于ｄＮ时（omega;＜１）表明受到负选择；ｄＳ小于ｄＮ时（omega;＞１）表明受到正选择［１］。光敏色素（Ｐｈｙ）是一类红光／远红光受体，在植物整个生长发育过程中都起重要的调节作用［２－４］。Ｐｈｙ分子是由大约１１００个氨基酸残基的脱辅基蛋白和１个线性的四吡咯环生色团通过共价键链接构成。其Ｎ端是光感受区，包括后色胆素裂解酶亚结构域（Ｂｉｌｉｎｌｙａｓｅｄｏｍａｉｎ，ＢＬＤ）和光敏色素亚结构域（Ｐｈｙｔｏｃｈｒｏｍｅｄｏｍａｉｎ，ＰＨＹ），ＧＡＦ（ｃＧＭＰ－ｓｐｅｃｉｆｉｃｐｈｏｓｐｈｏｄｉｅｓｔｅｒａｓｅ／ａｄｅｎｙｌａｔｅｃｙｃｌａｓｅｓ／ｆｏｒｍａｔｅｈｙｄｒｏｇｅｎｌｙａｓｅｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ）结构域包含于ＢＬＤ结构域中，是发色团结合的部位，高度保守［５－６］；Ｃ端是光调节区，光调节区域含有２个ＰＡＳ（Ｐｅｒ／Ａｒｎｔ／Ｓｉｍ）同源重复序列和１个组氨酸激酶类作用区（Ｈｉｓｔｉｄｉｎｅｋｉ