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运用基因芯片技术检测牛、山羊、猪和鸡源性成分

生 物 工 程 学 报 Chin J Biotech 2010, June 25; 26(6): 823−829 Chinese Journal of Biotechnology ISSN 1000-3061 cjb@ ©2010 CJB, All rights reserved. 生物技术与方法 运用基因芯片技术检测牛、山羊、猪和鸡源性成分 1,2 3 1 2 2 2 2 石丰运 ,缪建锟 ,张利平 ,陶虹 ,吕建强 ,阮周曦 ,宗卉 1 甘肃农业大学动物科学技术学院,兰州 730070 2 深圳出入境检验检疫局,深圳 518010 3 中国农业大学农业生物技术国家重点实验室,北京 100193 摘 要: 本研究通过对脊椎动物分子标记基因进行序列分析,最终选择线粒体DNA (mtDNA) 16S rRNA 基因为目标基 因,利用一对通用引物,在该引物扩增区间设计了4 条特异性基因芯片检测探针及2 条质控探针用于对牛、山羊、猪、 鸡等4 种动物源性成分进行检测。通过对PCR 扩增体系及杂交体系的优化,该检测方法能实现对上述4 种动物源性成 分同时进行快速、准确地检测,具有很好的特异性,灵敏度均达到 1 pg,最终建立了这4 种动物源性基因芯片检测方 法。该基因芯片检测技术将为我国进出口饲料中的动物源性成分的鉴别提供新的检测方法和技术支持。 关键词: 线粒体 16S rRNA 基因,DNA 芯片,动物源性 Detection of bovine, goat, pig and chicken derived ingredients in animal products with universal PCR-microarray method 1,2 3 1 2 2 2 Fengyun Shi , Jiankun Miao , Liping Zhang , Hong Tao , Jianqiang Lü , Zhouxi Ruan , and Hui Zong2 1 Faculty of Animal Science and Technology, Gansu Agricultural University, Lanzhou 730070, China 2 Shenzhen Entry-exit Inspection and Quarantine Bureau, Shenzhen 518010, China 3 State Key Laboratory of Agro-biotechnology, China Agricultural University, Beijing 100193, China Abstract: We analyzed the sequence of vertebrate molecular marker genes, then we selected the mitochondrial DNA (mtDNA) 16S rRNA gene as marker gene. In order to detect four kinds of animal-derived ingredients, which including bovine, goat, pig and chicken. We utilized a pair of universal primers, designed four sets of species-specific microarray probes and two pairs of

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