几何形态学_关于形态定量比较的科学计算工具_白明.pdfVIP

2014 年 第 59 卷 第 10 期：887 ~ 894 《中国科学》杂志社 评 述 SCIENCE CHINA PRESS 几何形态学: 关于形态定量比较的科学计算工具 ① ①* ② ② 白明 , 杨星科 , 李静 , 王文成 ① 中国科学院动物进化与系统学院重点实验室, 中国科学院动物研究所, 北京 100101; ② 计算机科学国家重点实验室, 中国科学院软件研究所, 北京 100190 * 联系人, E-mail: yangxk@ 2013-07-19 收稿, 2013-09-09 接受, 2014-03-10 网络版发表 国家重点基础研究发展计划(2011CB302102)、国家自然科学基金(31010103913,、中国科学院知识创新工程 重要方向项目(KSCX2-EW-G-4)和德国洪堡基金资助 摘要 形态比较是人类认识世界的重要方法. 长期以来, 定性比较方法因其简单易用而得到广 关键词 泛应用. 然而定性的形态比较具有很多局限性, 远不能满足当前需求. 因此, 形态定量比较方 几何形态学 法势在必行. 几何形态学是关于形态定量比较的科学计算工具, 主要应用于生物学领域, 但其 科学计算 研究方法与理念完全可以移植到其他学科, 并具有巨大的潜在应用前景. 本文先对其简史、原 生物 艺术与人文 理及在生物学领域应用的流程进行了简述, 接着对其在非生物学领域应用的几个典型案例进 工程 行解析, 并对还未应用几何形态学但具发展潜力的领域进行概述, 提出: 如何将相关问题图形 化并确保代表性、可比性以及标准化处理, 是几何形态学在非生物领域应用的关键所在. 最后, 对几何形态学的发展前景进行了展望, 特别指出其在生物学领域将向规模化和整合化两个方 向发展, 而应用于其他学科领域时, 具有一定的普适性和先进性. 最终希望为我国科研工作者 在形态定量比较方面的工作提供一些借鉴. 形态比较是人类认识世界的重要方法 . 该方法 于图论的应用数学分支 , 能够定量地分析和比较形 起源非常早 , 目前仍然在潜移默化地影响着人类日 态差异 . 该学科自 20 世纪 80 年代起源至今, 得到了 常生活以及科学研究的各个方面. 究其原因, 主要是 迅猛发展 , 其应用领域也从最早的生物学领域拓展 该方法在定性比较时 , 有简单易用的特点, 而且能够 到众多需要形态定量比较的领域, 如地理学、医学、 在一定程度上获得令人满意的结果 . 然而定性的形 化学、考古学等 . 几何形态学之父 Rohlf 因该方法在 态比较具有很多局限性 , 如无法精确地记录与描述 各学科的广泛应用和深远影响而当选美国科学院院 形态间的差异、无法处理海量数据、难以利用众多的 士 . 在国内, 白明和杨星科[1] 曾首次较系统地介绍了 数学工具进行分析等, 故形态定量比较方法已是势在 该领域的理论基础和方法 , 许多学者也在生物学不 必行