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共同限制性内切核酸酶识别序列
常见限制性内切酶识别序列(酶切位点)(BamHI、EcoRI、HindIII、NdeI、XhoI等)
Time:2009-10-22 PM 15:38 Author:bioer Hits: 7681 times
在分子克隆实验中,限制性内切酶是必不可少的工具酶。
无论是构建克隆载体还是表达载体,要根据载体选择合适的内切酶(当然,使用T载就不必考虑了)。先将引物设计好,然后添加酶切识别序列到引物5 端。常用的内切酶比如BamHI、EcoRI、HindIII、NdeI、XhoI等可能你都已经记住了它们的识别序列,不过为了保险起见,还是得查证一下。
下面是一些常用的II型内切酶的识别序列,仅供参考。先介绍一下什么是II型内切酶吧。
The Type II restriction systems typically contain individual restriction enzymes and modification enzymes encoded by separate genes. The Type II restriction enzymes typically recognize specific DNA sequences and cleave at constant positions at or close to that sequence to produce 5-phosphates and 3-hydroxyls. Usually they require Mg 2+ ions as a cofactor, although some have more exotic requirements. The methyltransferases usually recognize the same sequence although some are more promiscuous. Three types of DNA methyltransferases have been found as part of Type II R-M systems forming either C5-methylcytosine, N4-methylcytosine or N6-methyladenine.
酶
类型
识别序列
ApaI
Type II restriction enzyme
5GGGCC^C 3
BamHI
Type II restriction enzyme
5 G^GATCC 3
BglII
Type II restriction enzyme
5 A^GATCT 3
EcoRI
Type II restriction enzyme
5 G^AATTC 3
HindIII
Type II restriction enzyme
5 A^AGCTT 3
KpnI
Type II restriction enzyme
5 GGTAC^C 3
NcoI
Type II restriction enzyme
5 C^CATGG 3
NdeI
Type II restriction enzyme
5 CA^TATG 3
NheI
Type II restriction enzyme
5 G^CTAGC 3
NotI
Type II restriction enzyme
5 GC^GGCCGC 3
SacI
Type II restriction enzyme
5 GAGCT^C 3
SalI
Type II restriction enzyme
5 G^TCGAC 3
SphI
Type II restriction enzyme
5 GCATG^C 3
XbaI
Type II restriction enzyme
5 T^CTAGA 3
XhoI
Type II restriction enzyme
5 C^TCGAG 3
要查找更多内切酶的识别序列,你还可以选择下面几种方法:
1. 查你所使用的内切酶的公司的目录或者网站;
2. 用软件如:Primer Premier5.0或Bioedit等,这些软件均提供了内切HYPERLINK /tag.php?tag=酶识别序列酶识别序列的信息;
3. 推荐到NEB的REBASE数据库去查(网址:HYPERLINK /rebase/rebase.html/rebase/rebase.html)
当你设计好引物,添加上了内切HYPERLINK /tag.php?tag=酶识别序列酶识别序
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