详解 Linux系统集群的安装与并行计算.docVIP

　　详解 Linux系统集群的安装与并行计算 　　1.Linux安装 　　安装过程就不多说了。需要注意的是安装时，如果机群不与外界联网则可以不考虑安全方面的因素而把rsh选为可信赖的服务，注意安装相应的软件包；如果还要与外界保持联网，出于安全需要应把ssh选为可信赖的服务。安装以后，应该保证各节点之间能够用ssh相互登录。每个节点的sshd都应该能正常提供服务。主机名：node1...noden (我所构 　　建的系统n=2) 　　2.创建NFS服务 　　在服务器节点public目录下建立mpi目录，并将其配置成NFS服务器，在/etc/exports文件中加入一行： 　　/public/mpi node1(rpi nfs rpi这个目录从服务器节点输出，并装载在各客户端，从而便于在各节点间分发任务 　　3.修改/etc/hosts文件 　　将所有节点名称极其ip地址填入。例如： 　　　localhost.localdomain localhost 　　　node1 　　　node2 　　. 　　每个节点都进行类似的配置。这样做的目的是使节点之间能够通过node1 ... noden的名称相互访问。你可以通过ping noden 或 ssh noden进行测试。 　　4.修改(或创建)/etc/hosts.equiv文件 　　将所有你允许访问本机进行mpi计算的机器名填入，一行一个机器名。这一步是为了使节点对其它的节点放权。 　　例如，我的node1是我用于启动mpi集群计算的机器，其他的节点是参与计算者，在node 1的/etc/hosts.equiv文件是这样的： 　　node1 #给自己放权，这样在只有一台机器时也可以模拟并行计算环境 　　node2 　　..... 　　noden 　　在node2...noden的/etc/hosts.equiv文件： 　　node1 #对node1放权 　　node2 　　...... 　　noden 　　5.修改~/.bash_profile文件 　　首先决定一个用于启动集群计算的用户名，不提倡使用root进行集群计算。这里在每个节点上建立新用户chief，他们的主目录都是/home/chief，必须采用同样的密码，将来　的计算程序必须放在相同的路径上。譬如你的程序为：fpi.f和a.out，则必须把a.out放在同样的路境内，比如~/mpirun/a.out，每个节点都是如此。 修改~/.bash_profile文件，主要是加入下列几行脚本： 　　export PATH=$PATH:/usr/local/mpich/bin 　　export MPI_USEP4SSPORT=yes 　　export MPI_P4SSPORT=22 　　export P4_RSHMAND=rsh 或ssh 　　这里我们预定了将来mpich的运行环境安装在目录/usr/local/mpich下面。其余的三个变量是用来通知mpi运行环境采用rsh(或ssh)来作为远程shell。linux的运行环境到此就配置完毕了。 　　6.配置rsh 或ssh 　　对于采用rsh来作为远程shell运行MPI的用户只要保证在各个节点上都具有相同的用户，并把这一用户的密码设为空密码就可以运行了。 　　若采用ssh作为远程shell则按如下配置：以你设定的用于启动mpi计算的用户登录，运行ssh-keygen，这将生成一个私有/公开密钥对，分别存放在~/.ssh/identity和~/.ssh/identity.pub文件内。然后进行访问授权，运行： 　　cp ~/.ssh/identity.pub ~/.ssh/authorized_keys 　　chmod go-rail。 　　如果是使用su命令转为root用户的则很可能运行ntsysv并不出现ntsysvs实用程序。此时可以直接去修改/etc/xid.d下的rlogin, rsh ,tele的设置。用vi编辑器打开xin 　　etd.d: 　　vi /etc/xid.d 　　则可看到如下所示的配置文件: 　　关于rsh的设置如下 　　# default: off 　　# description: The rshd server is the server for the rcmd(3) routine and, 　　# consequently, for the rsh(1) program. The server provides 　　# remote 123下一页 ....，。execution facilities bers