遗传密码的使用PDFcreatedwithFinePrintpdfFactoryProtrial.PDFVIP

第七章 遗传密码的使用 5端到3端阅读的一段DNA 编码序列包括一系列三联体核苷酸(密码子)，对应着蛋 白质中 N 端到C 端的一系列氨基酸。DNA 和蛋白质序列使直接比较相应的核苷酸和氨 基酸序列成为可能。有 64 个密码子(每个密码子的三个位置都有 4 种可能的碱基所以有 3 4 =64 种可能的三联体核苷酸序列) 。每个密码子(Codon)在蛋白质合成中都有其独特的含 义：61 个密码子代表氨基酸；3 个密码子引起蛋白合成的终止。 编码氨基酸的密码子的含义由与之相应的tRNA 决定；终止密码子(Termination codon) 的含义由蛋白因子本身决定。 遗传密码的最初破译表明遗传信息以核苷酸三联体的形式储存，但并没有揭示 每个 密码子是如何与专一的应氨基酸相对应的。在测序技术出现之前，主要通过两种类型的体 外研究来推测密码子的含义的。一个与多核苷酸链翻译有关的体系在 1961 年出现， Nirenberg 发现聚尿苷酸(PolyU)指导苯丙氨酸聚合为聚苯丙氨酸。这意味着 UUU 一定编 码苯丙氨酸。另一体系后来被建立，在这一体系中三联体核苷酸用来模拟密码子使相应的 氨酰-tRNA 结合在核糖体上。知道氨酰-tRNA 所携带的氨基酸成分，也就知道了密码子的 含义。用这两种技术一起破译了所有编码氨基酸的密码子。 图7.1 总结了所有的密码子，由于密码子的数量(61) 比氨基酸的数量(20)多，所以几乎 所有的氨基酸都有超过一个的密码子编码。只有甲硫氨酸和色氨酸例外。有相同含义的密 码子称为同意密码子(Synonyms)。因为遗传密码的阅读是在mRNA 上进行的，所以通常用 出现在RNA 上的碱基U 、C、A 、G 表示。 图7.1 所有的 64 个三联体密码都是有意义的： 图 7.2 某个氨基酸密码子数目的多少，与该氨 61 个代表氨基酸，3 个使翻译终止。 基酸在蛋白质中出现的频率没有多大联系。 1 PDF created with FinePrint pdfFactory Pro trial version 编码相同或相近氨基酸的密码子在序列上往往相似。一般来说密码子的第三个位置不 是特别重要，因为四个编码同一种氨基酸的密码子只在第三位上不同。有时这一位点上的 不同 是嘌呤和嘧啶之间的不同造成的。密码子最后一位碱基专一性降低的现象称为第三 位碱基的简并性(Third-base degeneracy) 。 密码子的翻译需要与相应的氨酰-tRNA 上的反密码子(Anticodon)配对。这个反应发生 在核糖体上：单独三联体核苷酸太短不能稳定配对，但核糖体A 位点可以提供一个使配对 稳定的环境。密码子与反密码子间的碱基配对不仅仅是A-U 和 G-C 间的配对。核糖体提 供的环境使前两个碱基的配对按照以上的方式进行，第三个碱基可以发生更多的反应。所 以一种氨酰-tRNA 可以识别多于一种的密码子，这与简并性也是一致的。另外，配对也可 能受到tRNA 上特定碱基的影响，尤其是靠近反密码子的碱基。 相似的密码子编码相同的氨基酸这种趋势可以降低突变的作用。这使一个碱基的变化 不引起氨基酸替代或替代为性质相近的氨基酸的可能性提高。例如，CUC 突变为CUG 不 产生任何效应，因为这两种密码子都编码亮氨酸；CUU 突变为AUU 引起亮氨酸替代为 异亮氨酸，这个氨基酸与前者性质相近。 图7.2 根据氨基酸在蛋白质(E. coli) 中出现的几率列 编码每一种氨基酸的密码子的数 量。只有一个很微弱的趋势表明更常用的氨基酸拥有更多的密码子，所以遗传密码似乎没 有根据氨基