基于SSR的中国糜子遗传多样性分析.PDFVIP

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基于SSR的中国糜子遗传多样性分析.PDF

J.SHANXIAGRIC.UNIV.(NaturalScienceEdition) 岛硼 学}匿f自然科学版)2o15.35(2):137 003231 基于 SSR的中国糜子遗传多样性分析 季煦 ,王瑞云 ,孙 ,曳水瑛 ,刘晓欢 ,杨阳 ,刘笑瑜 ,连帅 (1.山西农业大学 农学 院,山西 太谷 030801;2.农业部黄土高原作物基 因资源与种质创制重点实验室 ,山西 太原 030031) 摘 要 :以 40份 来 自中 国的糜子种质 资源为材料 ,利 用 5对糜 子特异 性 SSR 引物研 究上 述试材 的遗传 多样 性,以期 为糜子育种提供一定的理论数据 。结果表 明,4O份试材 中共检测 出 14个等位基 因位 点,每对 引物的等位位点数在 2~5之 间,平均为3.5。PIC值在 0.42~O.69之间,平均为0.52。相似性系数分析表 明,遗传相似系数在 0.6l~O.99 之间,平均为 0.8;聚类分析结果发现 ,在相似 系数 0.68处将 40个品种分为 5大类群 ,第一类群共 12个 品种 ,属于北 方春糜子区;第二类群共 7个 品种 ,属于西北春夏糜子区;第三类群共 16个品种 ,大多属于华北夏糜子区;第四类群 的 4个品种来 自不 同的生态区,包括东北春糜子区、北方春糜子区、黄北高原春夏糜子区和华北夏糜子区;第五类群只有 来 自山东的 1个品种 ,来源于华北夏糜子生态区。该结果可为 中国糜子的分类 以及育种提供参考依据。 关键词 :糜子 ;SSR;遗传 多样性 ;聚类分析 中图分类号 :S516 文献标识码 :A 文章编号 :1671-8151(2015)02—0137—06 TheAnalysisofGeneticDiversitiesinBroomcornMillet(Panicummiliaceum L.)basedonSSRMarkers JiXu ,WangRuiyun’’ ,YeShuiying’,LiuXiaohuan’,YangYang’,LiuXiaoyu’,LianShuai (1.CollegeofAgriculture,ShanxiAgriculturalUniversity,TaiguShanxi030801,China;2.KeyLaboratoryof CropGeneResourcesand Germplasm EnhancementonLoessPlateau,MinistryofAgriculture,TaiyuanShanxi 030031,China) Abstract:UsingfivepairsofSSR primers,40broomcornmillet(Panicum miliaceam L.)varietiesfrom Chinawerean— alysedongeneticdiversitiestoprovideacertainamountoftheoreticaldataforthebreedingofbroomcorn millet.The resultsshowedthat14allelesweredetected,and2to5allelescouldbedetectedwithanaverageof3.5allelesforeach primer.Therangeofpolymorphism informationcontentwas0.42to0.69,withanaverageof0.52.Revealedbyanal— ysisofsimilaritycoefficient,thegeneticsimilarityof40varietiesvariedfrom 0.61to0.99andthemeanvaluewas 0.8.Theclusteringresultsshowedthatthe40varietieswereclusteredinto5groupsatthegeneticsimilarityvalueof 0.68.Thefirstgroup including 12varietiesbelongedtoNorthSpringM illetarea;thesecondgroupwastheNorthwest

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