图3-着色问题的o(2n)链数dna计算机算法 an o(2n) volume molecular solutions for the 3-colorable problem on dna-based supercomputing.pdfVIP

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2017-08-22 发布于上海
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图3-着色问题的o(2n)链数dna计算机算法 an o(2n) volume molecular solutions for the 3-colorable problem on dna-based supercomputing.pdf

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图3-着色问题的o(2n)链数dna计算机算法 an o(2n) volume molecular solutions for the 3-colorable problem on dna-based supercomputing

第1l期电子学报 vd．36No．1l 2006年11月 Aa『AⅡ正CIRONICAS哪o～ Nov．2懈李肯立1，周旭1，许进2 (1．湖南大学计算机与通信学院。湖南长沙410082；2．华中科技大学分子生物计算机研究所，湖北武汉430074) 摘要：随着DNA计算的不断发展，如何克服穷举算法带来的指数爆炸问题已成为DNA计算领域的蕈要研究间相结合的DNA计算模型进行扩展，通过设计顶点着色器、稀疏图／稠密图搜索器，提出一种用于求解图3．着色问题的DNA计算模型与算法．将本算法与同类算法对比分析表明：本算法在保持多项式操作时间的条件下，将求解／7,个顶点的图3．着色问题所需DNA分子链数从0(34)减少至0(2“)，改进了3．着色问题同类文献的研究结果．关键词：DNA超级计算；图3．着色问题；剪枝策略；NP完全问题中图分类号：TP384文献标识码： A 文章编号：0372-2112(2008)11．2096-06 An MolecularSolutionsforthe3-Colorable O(2仃)Volume ProblemonDNA—Based Supercomputing U Ken～li，ZHOUXul，XUJin2 (1．hodofco,m灯amt㈣／oas，／-／unanu,妇rs／ty．C／magsha。Hunan410082，‰； Tedmo／ogy，Wuhan，蚴430074．‰) 2．施缸如矿成∞d如。唧脚．Huadmng¨血嘶矿＆切Ⅻand DNAvolumewhichiIlcll鄹ina withthescaleof becomethebottleneck Al始t旧cl：The pure expommtially the删锄has howtodecreasethevolumeinDNA isofa intheresearchofDNA the problem．So ctmtimters computing．For greatsignificance tOdecreasethe ofthe DNA model the DNAvolume 3-colorable objective problem，animprovedcomputingbas啦Oilbiologicalop- elationsinthe the ofsdckersinthe r删 modeland solution sticker-basednxxielisiIlⅡo由Jced．F山tt℃mD佗．a Adleman-Upton space andDense are to DNA wherenew ofVertex ParallelSearcher ParallelSearcher solve aJgodthm algor