第四章 生物信息学软件及使用.pptVIP

核酸：序列同源性比较，分子进化树构建，结构信息分析，包括基元(Motif)、酶切点、重复片断、碱基组成和分布、开放阅读框（ORF），蛋白编码区（CDS）及外显子预测、RNA二级结构预测、DNA片段的拼接； 蛋白：序列同源性比较，结构信息分析（包括Motif，限制酶切点，内部重复序列的查找，氨基酸残基组成及其亲水性及疏水性分析)，等电点及二级结构预测等等； 本地序列与公共序列的联接，成果扩大。 Antheprot 5.0 Dot Plot 点阵图 Peptool Lite--- Dot Plot 点阵图 DNASIS 2.5 RNA 二级结构预测 DNASIS 2.5 tRNA 二级结构预测 RNAStructure 3.5 RNA 二结构预测 Omiga 2.0 ORF Map DNAStar 之 Protean 对氨基酸的亲疏水性分析：helical wheel 图 用软件设计PCR引物，测序引物或杂交探针； 设计克隆策略，构建载体； 做模拟电泳实验，即模拟核酸内切酶或内肽酶对相应的底物分子切割后的电泳行为； 蛋白跨膜区域分析，信号肽潜在断裂点预测。 Winplas 2.6 质粒构建 Atheprot 5.0 预测蛋白跨膜区域 Antheprot 5.0 预测信号肽断裂点 功能3. 用计算机管理实验室数据及文献资料 实验室结果的储存、管理和申报工作； 从网络数据库获得的序列文