基于转录组学测序的长白落叶松材性表达基因_赵佳丽.pdfVIP

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基于转录组学测序的长白落叶松材性表达基因_赵佳丽

44 4 Vol.44 No.4 第 卷第 期 东 北 林 业 大 学 学 报 2016 4 JOURNAL OF NORTHEAST FORESTRY UNIVERSITY Apr. 2016 年 月 DOI:10.13759/j.cnki.dlxb002 基于转录组学测序的长白落叶松材性表达基因1) 赵佳丽 张磊 张素芳 王艳红 张含国 ( ( ), ,150040) 林木遗传育种国家重点实验室 东北林业大学 哈尔滨 (Sequencing By Synthesis ,SBS) , Illumina HiSeq2500 摘 要 基于边合成边测序 技术 使用 高通量测序平台对 cDNA 。 58 683 , 55 283 938 bp 。 长白落叶松 文库进行测序 共获得非重复序列基因 条 总长度为 将得到的转录本使 BLAST NR、Swiss -Prot 、GO、COG、KEGG , BLAST E - 用 软件将非重复序列基因序列与 数据库比对 通过选择 参数 value 10-5 , 29 350 , 19 292 GO , 9 112 不大于 最终获得 个有注释信息的基因序列 其中 个转录本注释 编号 有 个转录 COG 25 , 120 KEGG 。 本在 数据库中被注释并分为 个功能分类 同时注释到 条 代谢途径 在得到注释的转录本中搜 68 , 29 , 27 ; 147 索到木质素相关基因共 条 其中与木质素合成相关基因 条 与木质素分解代谢相关基因 条 找到了 , 103 , 44 。 条纤维素相关基因 其中与纤维素合成相关基因 条 与纤维素分解代谢相关基因 条 ; ; ; 关键词 长白落叶松 转录组 高通量测序 材性基因 分类号 S791.225 Gene Expression of Wood Properties Based on Transcriptome of Larix olgensis / / Zhao Jiali ,Zhang Lei ,Zhang Su- fang ,Wang Yanhong ,Zhang Hanguo (State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding ,Northeast Forestry University , Harbin 150040 ,P . R. China)/ / Journal of Northeast

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