猪STCH基因的Bi-PASA遗传标记及多态性研究.pdfVIP

维普资讯 动 物 学 研 究 2005，Feb．2．6 (1)：76—81 CN53—-1040／Q ISSN0254—-5853 Zoologic【alResearch 猪 STCH基因的Bi．PASA遗传标记及多态性研究 史宪伟 ，魏 麟l，韩洪金 (1．云南农业大学 动物科学技术学院，云南省生物多样性与生物技术人才培养基地 ，云南 昆明 650201； 2．中国科学院昆明动物研究所 云南省畜禽分子生物学重点实验室，云南 昆明 650223) 摘要：微粒体应激70蛋 白三磷酸腺苷酶 (STCH)基因属于应激 70蛋白基因伴侣家族，在机体免疫反应 和疾病抵抗力等方面起重要作用。根据人和小鼠STCH基因的保守序列设计引物，PCR扩增到猪 STCH基因第 5外显子445bp片段。序列测定显示，猪 STCH基因与人和小鼠STCH基因分别具有 87．13％和80．45％的同源 性。通过测定和比较中国梅山猪、欧洲约克夏猪及PIC商品猪的STCH基因序列，发现在猪STCH基因编码区 第5外显子1050位点上存在一个单碱基突变位点。利用双向特定等位基因PCR扩增法 (Bi—PASA)建立了检测 猪STCH基因变异的遗传标记，并用该标记分析了STCH基因在中国家猪 (梅山猪、荣昌猪和金华猪)、欧洲家 猪 (约克夏猪、大白猪)、商品猪 (PIC合成系)以及欧洲野猪的基因频率和多态性。本研究建立的Bi—PAsA遗 传标记和基因变异信息，将为进一步分析猪STCH基因变异与经济性状的相关分析提供基础资料。 关键词：猪；STCH；Bi—PASA；多态性；遗传标记 中图分类号：Q959．842 文献标识码 ：A 文章编号：0254—5853(2005)01—0076—06 Bi-PASA GeneticMarkerandPolymorphism of thePorcineSTCH Gene SHIXian—weil，WEILinl，，HANHong—iin2 (i．CollegeofAnimalScienceandTechnology，YunnanAgriculturalUniversy＆Centerof Boidiversityand Biotechnology，Kunmlng 650201，China；2．YunaanKeyLaboratoryofMolecularBiologyof DomesticAnimals，KunmingInstituteofZoology，tkChineseAcademyofSceinces，Kunmn／g 650223，China) Abstract：MicrosomMsrtess70proteinATPasecore(STCH)isamemberofthesrtess70proteinchaperonefamily andplaysamajorroleintheimmuneresponsenaddiseaseresistanceofhost．BasedonhteconservedregionsofSTCH genesequencesfromhumannadmouse，apairofprimerswas designedforPCRamplificationofporcineSTCH gene．A fragmentof445basepairs productintheexon5ofpigSTCH genewas successfullyma plifiedwithhteprimers．The porcineSTCH sequencedeterminedfrom thisrfagmentshowed87．13％ nad80．45％ nucleot