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第 44 卷 第 2 期 林 业 科 学 Vol44 ,No2 2 0 0 8 年 2 月 SCIENTIA SILVAE SINICAE Feb. ,2 0 0 8 白桦 ESTSSR 信息分析与标记的开发 王艳敏 　魏志刚　杨传平 ( 东北林业大学林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室 　哈尔滨 150040) ( ) 摘 　要 : 　对 NCBI 美国国立生物技术信息中心 中2 548 条欧洲白桦 ESTs 的序列进行分析 ,结果表明:其中260 条 ESTs 中含有 306 个 SSRs ,为全部 ESTs 序列的 102 % ,SSR 频率为 1201 % 。其中 ,二核苷酸重复比例为 8137 % ,三 核苷酸重复比例为 1667 % , 四核苷酸重复比例为 196 % 。不同软件设计引物的效率不同 ,Primer3 设计出 176 对 SSR 引物 ,在白桦中扩增成功的引物比例为 5909 % ,而具有多态性的引物比例仅为 2596 % ; SSR Primer 设计出 100 对引物 ,在白桦中扩增成功的引物比例为 37 % ,而具有多态性的引物比例为 4865 % 。 关键词 : 　欧洲白桦 ; 白桦 ; EST; SSR ; 标记 ( ) 中图分类号 :S71846 　　　文献标识码 :A 　　　文章编号 :1001 - 7488 2008 02 - 0078 - 07 Data Mining for SSRs in ESTs and ESTSSR Marker Development in Betula platyphylla Wang Yanmin 　Wei Zhigang 　Yang Chuanping ( Key Laboratory of Forest Tree Genetic Improvement and Biotechnology of Ministry of Education 　Northeast Forestry University 　Harbin 150040) Abstract : 　Through the sequence analysis of 2 548 ESTs in Betula pendula deposited in NCBI , we found that 306 SSRs were distributed in 260 ESTs out of 2 548 ESTs sequences , accounting for 102 % of the whole EST sequences. The frequency of SSR was 1201 % , in which , the repetitive proportions of dinucleotide , trinucleotide , and tetranucleotide were 8137 % , 1667 % , and 196 % , respectively. Moreover , the efficiency of primer design with various softwares was different. The software , Primer3 , designed 176 pai