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血清蛋白质质谱与支持向量机模型在胰腺癌检测上的应用-浙江大学学报
第41卷 第3期 浙 江 大 学 学报 (医学 版 ) Vol41 No3
2012年 JOURNALOFZHEJIANGUNIVERSITY(MEDICALSCIENCES) 2012
http: www.journals.zju.edu.cn/med DOI:10.3785/j.issn.10089292.2012.03.010
∥
血清蛋白质质谱与支持向量机模型
在胰腺癌检测上的应用
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竺杨文 ,王跃东 ,叶再元 ,胡 汛 ,余捷凯
(1.浙江省人民医院,浙江杭州310014;
2.浙江大学医学院附属第二医院肿瘤研究所,浙江杭州310009)
[摘 要] 目的:为提高胰腺癌的早期检测率筛选新的标志物,应用蛋白芯片结合表面增强激光
解吸电离飞行时间质谱(SELDITOF-MS)技术建立胰腺癌的血清蛋白质质谱模型。方法:用弱阳
离子交换芯片(CM10)结合SELDITOFMS技术检测了73例血清样本,其中31例胰腺癌,22例胰
腺炎,20例健康人。用支持向量机方法建立胰腺癌和健康人以及胰腺癌和胰腺炎的辨别模型。结
果:胰腺癌和健康人辨别模型用了3个蛋白质峰,辨别的敏感性和特异性均为100%,而胰腺癌和
胰腺炎辨别模型用了5个蛋白质峰,辨别的特异性和敏感性分别为95.5%和 93.5%。结论:
SELDITOFMS技术结合生物信息学方法检测胰腺癌具有较高的敏感性和特异性。
[关键词] 胰腺肿瘤/诊断;蛋白质组学;光谱法,质量,基质辅助激光解吸电离;肿瘤标记,生物
学;敏感性与特异性;血蛋白质类/分析
[中图分类号] R735.9 [文献标志码] A [文章编号] 10089292(2012)03028909
Applicationofserumproteinfingerprintindiagnosisofpancreaticcancer
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ZHUYangwen,WANGYuedong,YEZaiyuan,HUXun,YuJiekai(1.DepartmentofGeneral
Surgery,ZhejiangProvincialPeople’sHospital,Hangzhou310014,China;2.CancerInstitute,Second
AffiliatedHospital,ZhejiangUniversitySchoolofMedicine,Hangzhou310009,China)
[Abstract] Objective:Toestablishserumproteinfingerprintmodelforearlydiagnosisofpancreatic
cancerwithsurfaceenhancedlaserdesorption/ionizationtimeofflightmassspectrometry(SELDITOF
MS)andbioinformaticstechniques.Methods:Atotalof73sampleswereanalyzedinthisstudy,
including31casesofpancreaticcancers,22casesofpancreatitisand20healthyindividuals.Sampleswere
firstanalyzedbySELDITOFMSandtwopatternsofdifferentiationmodelwereconstructedwithsupport
vectormachinearithmeticmethod.Results:Thepattern1modeldifferentiatingpancreaticcancer
patientsfromhealthyindividualshadaspecificityandasensitivityofboth100.0%.Thepattern2mode
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