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Architecture and Database Design Document(体系结构和数据库设计文档)
Contract No. HHSN266200400006C
Immune Epitope Database and Analysis Program
System Architecture and Database Design Specification, v2.0
Curation v2.7.6 and External v2.9.0 releases
La Jolla Institute for Allergy and Immunology
9420 Athena Circle
La Jolla, CA 92037
858-752-6923
858-752-6987 (fax)
wfleri@
September 30, 2012
System Architecture and Database Design Specification
Table of Contents
TABLE OF CONTENTS I
1.0 INTRODUCTION 1
1.1 SCOPE 1
1.2 PURPOSE 1
1.3 ASSUMPTIONS AND DEPENDENCIES 1
1.4 KEY OBJECTIVES 2
1.5 CONTRACT IDENTIFICATION 2
1.6 REFERENCES 2
1.7 CHANGE PROCEDURES 3
2.0 SYSTEM ARCHITECTURE 4
2.1 SYSTEM OVERVIEW 4
2.1.1 Document Management Overview 4
2.1.2 IEDB Curation Overview 5
2.1.3 IEDB External Overview5
2.1.4 IEDB Analysis Resource Overview 5
T Cell Epitope Prediction Tools 5
B Cell Epitope Prediction Tools 6
Analysis Tools 7
2.2 HARDWARE ARCHITECTURE 9
2.3 SOFTWARE COMPONENTS 11
2.4 HARDWARE AND SOFTWARE RELATIONSHIPS 12
3.0 DATABASE DESIGN AND DATA MODELS 13
3.1 OVERVIEW OF THE IEDB DATABASE ARCHITECTURE 13
3.2 OVERVIEW OF IEDB DATABASE DESIGN 13
3.3 OVERVIEW IEDB DATABASE CONTENT 13
3.4 IEDB REFERENCE DATA FLOW 14
3.5 IEDB DATABASE BACKUP PROCEDURES 15
3.6 IEDB CURATION PHYSICAL DATA MODELS 17
3.6.1 IEDB Reference and Base Data Model. 17
3.6.2 IEDB TCell Data Model18
3.6.3 IEDB BCell Data Model 19
3.6.4 IEDB MHC Binding Data Model 20
3.6.5 IEDB MHC Ligand Elution Da
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