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项目公示内容 （公示内容由张红利老师提供） 一、 二、 姓名：黄原；排名行政职务技术职称工作单位完成单位对本项目主要学术和技术创造性贡献 姓名：汪晓阳；排名行政职务技术职称工作单位完成单位对本项目主要学术和技术创造性贡献测定并分析了7 姓名：李雪娟；排名行政职务技术职称工作单位完成单位对本项目主要学术和技术创造性贡献 姓名：刘念；排名行政职务技术职称工作单位完成单位对本项目主要学术和技术创造性贡献测定并分析了21种直翅目昆虫线粒体基因组全序列，发现可能存在两种参与线粒体基因组的复制起始调控的序列结构；首次构建了这些线粒体基因组22种tRNA和2种rRNA的通用二级结构模型及主要结构域的保守性一致序列。 姓名：周志军；排名行政职务技术职称工作单位完成单位对本项目主要学术和技术创造性贡献 姓名：张红利；排名行政职务技术职称工作单位完成单位对本项目主要学术和技术创造性贡献 姓名：叶海燕；排名行政职务技术职称工作单位完成单位对本项目主要学术和技术创造性贡献 姓名：赵玲；排名行政职务技术职称工作单位完成单位对本项目主要学术和技术创造性贡献3种蝗虫的线粒体基因组，构建了蝗总科8科15种昆虫的系统发育关系。 姓名：张辰艳；排名行政职务技术职称工作单位完成单位对本项目主要学术和技术创造性贡献 姓名：黄建华；排名行政职务技术职称工作单位完成单位对本项目主要学术和技术创造性贡献应用线粒体同时分析显示 三、 在项目进行时，完成人汪晓阳、李雪娟、刘念、周志军、张红利、叶海燕、赵玲、张辰艳为陕西师范大学生命科学学院研究生，是项目参与人，负责项目的具体实施。 完成人黄建华在项目进行时为陕西师范大学生命科学学院博士后研究人员，是项目参与人，负责项目的部分规划和实施。 主要完成单位排序及贡献 陕西师范大学是本项目的唯一依托和完成单位，主要负责组织并完成了项目策划和实施工作；为项目的顺利实施提供了人力资源与优质的工作环境与场所；提供了本项目所需的设备、能源、图书资料和数据库等资源。 完成单位合作关系说明 无 六、项目简介 本研究成果是在三个国家自然科学基金项目30970346的支持下，从结构、比较、进化和谱系基因组学方面对直翅目昆虫和鸟类的线粒体基因组进行了系统的研究。成果的主要内容包括： 测定了直翅目昆虫2亚目3总科12科19种和4种鸡形目与10种雀形目鸟类的线粒体基因组序列，表征了这些线粒体基因组的组织结构及其序列特征。发现了这些线粒体基因组的新特征，包括在长尾山雀属和黄眉林雀的线粒体基因组控制区中发现了串联重复序列；在黄脸油葫芦线粒体基因组中发现了一种新的基因排列方式；在亚洲飞蝗的线粒体基因组N链上发现了3个tRNA类似序列等。 通过比较已知的直翅目昆虫线粒体基因组，构建了21种蝗虫的12S rRNA 和16S rRNA的二级结构和所有22个tRNA的二级结构；比较了控制区可能存在的调控序列和保守基序；总结了蛋白质编码基因的起始和终止密码子使用规律。 线粒体基因组的进化分析显示马鸡属线粒体atp8基因与高原适应相关并受到强烈的选择作用；山鹧鸪属的线粒体基因组在进化过程中受到选择作用的影响积累了更多的非同义替换；黄眉林雀线粒体控制区重复单元在所有取样个体中绝大多数排序状态都有多个起源，重复单元的数量变化呈现出异常多样的模式。 线粒体谱系基因组分析建立了直翅目昆虫主要类群和马鸡属和山鹧鸪属鸟类的系统发育关系，并解决了直翅目昆虫中存在的一些分类学问题。 研究成果先后在SCI期刊发表原创性学术论文13篇，其中二区论文3篇，国内核心期刊7篇。研究成果发表后得到了国内外同行的高度关注，被本领域国内外著名学者发表的研究论文正面评价或引用228次，其中被他人引用172次。 七、主要论文专著目录和主要 1. Xuejuan Li, Yuan Huang, Fumin Lei. Comparative mitochondrial genomics and phylogenetic relationships of the Crossoptilon species (Phasianidae, Galliformes). BMC Genomics. 2015 Feb; 16:42. doi: 10.1186/s12864-015-1234-9. 2. Xiaoyang Wang, Nian Liu, Hongli Zhang, Xiaojun Yang, Yuan Huang, Fumin Lei. Extreme variation in patterns of tandem repeats in mitochondrial control region of yellow-browed tit