日本血吸虫成虫的非编码rna高通量测序分析-热带病与寄生虫学.pdfVIP

热带病与寄生虫学2017年第15卷第1期 JournalofTropicalDiseasesandParasitology2017.Vol15.No.1 ·31 · doi:10.3969/j.issn.1672-2302.2017.01.009 ·论著· 日本血吸虫成虫的非编码RNA 高通量测序分析 喻祎哲 杨杰 曾凡胜 王红梅 秦志强* 【摘要】目的 通过对日本血吸虫成虫做高通量测序分析，鉴定已知miRNA的表达水平，预测新 miRNA的序列结构及生物学功能。方法 首先提取日本血吸虫成虫miRNA进行深度测序，其次对 miRNA做数据分析、统计长度分布与比对注释，鉴定已知miRNA表达水平，最后对发现的新miRNA序 列进行结构和功能的预测。结果 将构建文库中日本血吸虫表达的miRNA与最新SangermiRBase数据 库中的miRNA比对。结果显示，在鉴定的miRNA中，sja-mir-125b是表达量最高的miRNA，另外sja- bantam，sja-mir-10，sja-mir-71a，sja-mir-36，sja-mir-61的表达量也较高，上述六种miRNA表达量占到 已知miRNA表达量的94.6%。本研究发现了十种在日本血吸虫表达量最高的新miRNA，并对新miRNA 进行序列及结构的预测。结论 日本血吸虫成虫新miRNAs例如sja-mir-125b的发现将为深入研究其在 血吸虫发育与致病的生物学功能打下基础。 【关键词】非编码核糖核酸；miRNA；高通量测序； 日本血吸虫病；成虫 Analysisofthenon-codingRNAinadultSchistosomajaponicumbyhigh-throughputsequencing Yu 1 2 2 2 3 Yizhe,YangJie,ZengFansheng,WangHongmei,QinZhiqiang* 1.No. 1MiddleSchoolofYiyangCity, Yiyang 413000,China. 2.YiyangMedicalCollege,Yiyang 413000,China. 3.NationalInstituteofParasiticDiseases,Shang⁃ hai200025,China.*CorrespondingAuthor. 【Abstract】Objective TopredictthemiRNAsequenceanitsbiologicalfunctionbydeterminingthe miRNAexpressionlevelinadult Schistosomajaponicumwithhigh-throughputsequencingtechnique. Methods ThemiRNAsofSchistosomajaponicumwereextractedandanalyzedbyhigh-throughputsequencing.Lengthdis⁃ tributionandexpressionlevelsofmiRNAswereidentifiedandannotated.Thenthestructureandexpressionof newlyidentifiedmiRNAsequenceswerepredictedwithsoftwaretool,andalignedwith Schistosomajaponicum miRNAsinlibraryoflatestSangermiRBasedatabase. Results Inthe SchistosomajaponicummiRNAs,sja-mir- 125bwasmaximallyexpressed,followedbysja-bantam,sja-mir-10,sja-mir-71a,sja-mir-36andsja-mir- 61,whichaccountedfor 94.6%oftheknownmiRNAs.Additionally,tennewmiRNAsof Schistosomajaponi⁃ cumwerefound,andtheirsequencesandstructureswerefurtherpredicted. ConclusionNove