河豚鱼16srrna基因部分dna序列分析及应用-河南农业科学.pdfVIP

140 2015, Vol.36, No.21 食品科学 ※生物工程 河豚鱼16S rRNA基因部分DNA序列分析及应用 1 2 3 1 1 1 1 陈文炳，翁国柱，陈融斌，缪婷玉，邵碧英，江树勋，彭  娟 （1.福建出入境检验检疫局技术中心，福建 福州 350001 ； 2.莆田出入境检验检疫局，福建 莆田 351100 ；3.集美大学水产学院，福建 厦门 361021 ） 摘  要：应用16S rRNA基因聚合酶链式反应（polymerase chain reaction ，PCR ）扩增通用引物，对3 属13 种福建省 搜集的河豚鱼样品与9 个未知物种的河豚鱼样品的16S rRNA基因序列中的部分片段进行PCR扩增与脱氧核糖核酸 （deoxyribonucleic acid ，DNA ）碱基序列测定，各物种序列长度在611～614 bp之间。应用DNAMAN V6软件进行 样品间DNA序列同源性比对分析，建立样品间系统关系同源树。供试13 个样品被划分为4 个类群组，群间的同源 率为87%，群内同源率为94%～100% 。根据序列同源性分析结果，9 个未知种名的样品被归类到3 个类群组中，推 测9 个未知种名的样品为东方鲀属或腹刺鲀属。探讨了16S rRNA基因部分DNA序列测试及同源性分析技术在河豚 鱼种属鉴别中应用的可能性。 关键词：河豚鱼；聚合酶链式反应；16S rRNA基因；DNA测序；物种鉴定 Partial DNA Sequence Analysis of 16S rRNA Gene in Puffer Fish 1 2 3 1 1 1 1 CHEN Wenbing , WENG Guozhu , CHEN Rongbin , MIAO Tingyu , SHAO Biying , JIANG Shuxun , PENG Juan (1. Inspection and Quarantine Technology Center, Fujian Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau, Fuzhou 350001, China; 2. Putian Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau, Putian 351100, China; 3. Fisheries College, Jimei University, Xiamen 361021, China) Abstract: Partial fragments of the 16S rRNA gene of puffer fish from 13 species belonging to 3 genus collected from Fujian province and 9 samples from unknown species were amplified by polymerase chain reaction (PCR) using the universal 16S rRNA gene primers. The PCR products were sequenced, and the length of the obtained DNA fragments were 611–614 bp in all samples. The homology of DNA sequences among samples was analyzed with the DNAMAN V6 software, and the phylogenet