中科曙光基因数据与存储平台方案概念.docx

基因数据分析与存储平台建设方案平台建设需求分析平台组成生物信息学研究平台可分为测序平台和分析平台两部分，测序平台以基因测序仪为核心，完成基因测序，获得原始数据；分析平台以高性能计算软硬件系统为核心，完成数据的分析处理，获得分析结果。其中，基因数据存储与分析平台即生物信息高性能计算系统通常包括：计算子系统（刀片节点、胖计算节点、管理登陆节点）存储子系统（在线存储系统、备份存储系统）网络子系统（高速计算存储网络、低速管理网络）管理调度系统（操作系统、集群管理系统、作业调度系统、KVM）基础软件环境（编译器、数学库、并行环境等）应用软件环境（生物信息平台软件、应用软件与基因组数据资源）集群基础设施（机柜、配电系统）机房环境（机房、制冷、监控、消防、隔音、供电等）系统应用分析生命科学做为21世纪最重要的科学分支之一，高性能计算在生命科学的研究和发展中起来非常重要的作用。由于测序技术的飞速发展，人类发现的基因序列数目按照指数级增长，那么对于如此数量庞大的基因进行同源性搜寻，比对，分析，遗传发育分析等等，往往伴随着巨大的数据处理量和并行计算量。同时，由于生命科学的研究对象往往是蛋白质和DNA的大分子，对这些分子的三维结构的预测，动力学特性、热力学特性、在生命过程中如何发生作用，这些科学问题也要借助于高性能计算机。所以高性能计算机在生命科学研究中，应用非常广泛，扮演着及其重要的角色。生物信息学研