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变性梯度凝胶电泳术的应用
变性梯度凝胶电泳技术在废水生物处理领域中的应用*
汪文斌郑 昱2 朱 亮3#
(1.湖州市环境科学研究所,浙江 湖州 313000;2.湖州市能源监察支队,浙江 湖州 313000;3.浙江大学环境与资源学院,浙江 杭州 310029)摘要 变性梯度凝胶电泳(DGGE)具有可靠性强、重复性好、操作便捷等特点,已被广泛应用于环境微生物领域群落结构多样性、动态分析以及功能菌群检测等领域。鉴于生物处理是目前废水处理处置中的主体工艺,通过DGGE技术研究来分析废水生物处理系统中的微生物种群多样性与群落结构动态演替,可对废水生物处理系统起到最优化设计与工程调控的指导作用。综述了DGGE技术在废水生物处理领域的研究与应用,并探讨了该技术在实际应用中存在的问题及其发展前景。关键词 变性梯度凝胶电泳 废水生物处理 微生物群落结构
Application of DGGE in biological degradation for wastewater treatmentWang Wenbin1,Zheng Yu2,Zhu Liang3 (1.Environmental Science Research Institute, Huzhou Zhejiang 313000;2.Energy Sources Supervision Detachment, Huzhou Zhejiang 313000;3. College of environmental and resource sciences of Zhejiang University, Hangzhou Zhejiang 310029)
Abstract: Biological degradation is the important process in wastewater treatment. According to denaturing of gradient gel electrophoresis (DGGE) analyzing of genetic diversity and monitoring the dynamic of microbial community, the proper wastewater treatment processes can be designed and controlled. The application of DGGE in study on biological degradation for wastewater treatment was strengthened. In application in microbial ecology, the problems and progresses of the technology were discussed.
Keywords: denaturing of gradient gel electrophoresis (DGGE);biological wastewater treatment;microbial community
生物处理是目前废水处理处置中的主体工艺具有运行成本低、操作简、出水水质好等优点,被广泛应用于工业和城市污水的。污泥膨胀、难降解有毒污染物导致处理系统崩溃等问题,深入了解活性污泥及生物膜微生物生态系统的区系组成、动态变化以及功能菌群,解析群落结构与系统之间的关系,已成为国内外学者的研究新热点[12]。微生物分离培养和显微镜技术等传统微生物学方法在研究复杂的微生态系统过程中存在很大的局限性不能全面、准确地表征微生物多样性、种群结构以及菌群演替等生态特性DNA指纹图谱,如变性梯度凝胶电泳(DGGE)[3]、温度梯度凝胶电泳(TGGE)[3]、单链构象多态性技术(SSCP)[4]、末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)[5]、扩增核糖体DNA限制性酶切片段分析(ARDRA)[6]等分子生物学的应用,大大拓宽了微生物分子生态学的研究视野,将废水生物处理领域研究带入了一个革命性的新时代。近年来,DGGE技术因其可靠性高、分析速度快、操作简单等特点广泛用于分析活性污泥、生物膜的微生物遗传多样性以及群落动态本文在简述DGGE技术基本原理的基础上,对该技术在废水处理领域的应用研究。
1 DGGE技术原理
DGGE是由F和L创立的用于DNA突变检测的一种电泳技术,其原理是基于不同序列的DNA片段双螺旋解链温度(Tm)DNA在变性剂浓度呈线性梯度的聚丙烯酰胺凝胶中电泳到与Tm值对应的变性剂浓度点,双链DNA分子解旋变性导致电泳速度急剧下降,最终停留在凝胶中其相应的变性剂浓度位置,形成分散的条带。该技术可分辨具有相同或相近分子量的DNA片段序列差异,
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