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核糖体DNA ITS序列分析在药用植物探究中应用 　 作者：赵欢 吴卫 郑有良 潘红梅 翟娟园 【摘要】 药用植物核rDNA是高度重复的串联序列，由于同步进化的力量，大多数物种中这些重复单位间已发生纯合或接近纯合。5.8SrDNA把核rDNA的内转录间隔区分为ITS1和ITS2两部分。由于ITS序列变异较快，能够提供较丰富的变异位点和信息位点，已在药用植物鉴别、道地性研究、栽培与野生药用植物遗传差异分析、较低分类阶元的系统发育和分类研究中发挥重要作用。 【关键词】 核糖体DNA ITS区 药用植物 Abstract：Nuclear rDNA in the medicinal plants is a tandem sequence of highly repeatable units which become homogenized or nearly homogenized in most species. The internal transcribed spacers of nuclear rDNA was divided into ITS1 and ITS2by 5.8S rDNA. As mutate quickly, ITS sequences are capable of providing many variable sites and informative sites, which plays more and more important roles in the authentications of medicinal herbs, studies on the genuineness, genetic variation analysis between cultivated and wild medicine plants, systematic development and classification researches on the lower taxon of the medicinal plants. Key words：Nuclear rDNA; ITS sequence; Medicinal plants 人们对药用植物的研究有着悠久的历史。随着植物遗传学规律的发现与应用，植物大量次生代谢产物的分离与结果鉴定及其对系统学意义的探讨，进一步加深了人们对药用植物的认识。现代分子生物学技术的迅速发展，使以形态组织学、解剖学等客观指标为划分依据的传统分类学得到了补充，为药用植物系统与进化研究提供了丰富而翔实的资料，为解决分类学、系统发育、物种形成与进化等方面的难题提供了极为有力的技术途径［1］。中药用于疾病防治已有几千年的历史，但由于中药现代品质监控技术不足，常常出现药材混淆代用、故意伪制的现象，严重影响中药的声誉，甚至危及人身安全，建立健全完善的中药品质检测技术体系迫在眉睫。目前，越来越多的研究者将ITS应用于药用植物的鉴别，为揭示药用植物的遗传差异和鉴定中药材品种的道地性提供了新的方法和手段［2］。本文着重对核糖体DNA ITS序列分析在药用植物的鉴定、道地性研究、栽培与野生药用植物遗传差异分析及药用植物科以下等级系统与进化研究中的应用进行了综述。 1 18S-26S rRNA基因的基本结构 目前，核基因组序列在药用植物鉴定和品质研究中的应用主要集中在编码核糖体RNA 基因nrDNA 重复区内。高等植物细胞核中 nrDNA是高等植物中的rRNA基因(rDNA)是高度重复的串联序列单位，18S，5.8S和26S rDNA联结在一起，作为一个转录单位。18S-26S rDNA在植物中有一至数个位点［3］，拷贝数可达500～40 000，18S-26S rDNA基本结构由18S rDNA，26S rDNA，5.8S rDNA和位于三者之间的基因内转录间隔区(ITS)组成，其中ITS区由被5.8S rDNA所分隔的ITS1和ITS2两个片段组成［4］。其转录物(transcript)不加入成熟核糖体，只是部分地对nrDNA的成熟起作用。目前，国内外学者已利用nrDNA中的ITS片段序列作为分子标记，在药用植物鉴定和品质研究方面开展了许多有益的工作。 l8S-26S核rDNA ITS区在核基因组中高度重复，而且通过不等交换和基因转换，这些重复单位间已经发生了位点内和位点间的同步进化，即不同 ITS拷贝间的序列趋于相近或完全一致，且所受选择压力较小，碱基替换速率较快，进化速度快，加上片段长度变异很小，ITS1和ITS2的长度均不足300 bp，在绝大多数被子植物中不足700 bp，非常适合进行各种分子操作［5］。屈良鸽等通过对不同生物类群的ITS序列(自生物学数据库)的比较得出：被子植