栉江珧atrinapectinataest-ssr标记的开发与应用-渔业科学进展.pdf

第 38 卷 第 2 期 渔 业 科 学 进 展 Vol.38, No.2 2 0 1 7 年 4 月 PROGRESS IN FISHERY SCIENCES Apr., 2017 DOI: 10.11758/yykxjz.20151116001 / 栉江珧(Atrina pectinata )EST-SSR 标记的 开发与应用 1,2 2① 2 2 李东明 杨爱国 吴 彪 孙秀俊 2 1,2 1,2 周丽青 刘寒苗 张广明 (1. 上海海洋大学水产与生命学院 上海 201306 ；2. 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071) 摘要 本研究以前期获得的栉江珧(Atrina pectinata)转录组数据为基础，筛选获得 10550 条微卫 星标记(SSR) ，检出率为8.2% ，平均9.01 kb 出现1 个SSR 位点。设计并合成120 对SSR 引物，筛 选得到36 对能够稳定扩增的引物，并利用已获得的36 对SSR 引物对青岛海区栉江珧进行了群体 遗传多样性分析。结果显示，12 对引物的扩增片段表现出多态性，共产生42 个等位基因，平均每 个位点产生 3.5 个等位基因，平均观测杂合度(H ) 、平均期望杂合度(H )和平均多态信息含量(PIC) o e 分别为0.417、0.604 和0.526 ，表明青岛海区栉江珧群体的遗传多样性较高。本研究获得的EST-SSR 标记和群体遗传信息为栉江珧的种质资源保护提供了重要的参考资料。 关键词 栉江珧；EST-SSR ；遗传多样性；杂合度 中图分类号 Q178.53 文献标识码 A 文章编号 2095-9869(2017)02-0137-06 微卫星标记(Simple sequence repeat, SSR) 因具有 中报道。 多态性丰富、共显性等优点而被广泛应用于种群的遗 栉 江 珧 (Atrina pectinata ) 隶 属 于 软 体 动 物 门 传结构分析、遗传连锁图谱构建和分子标记辅助育种 (Mollusca) 、 瓣 鳃 纲 (Lamellibranchia) 、 翼 形 亚 纲 等。与传统 SSR 开发技术相比，基于 EST 序列开发 (Pterimorphia) 、贻贝目(Mytiloida) 、江珧科(Pinnidae) 、 SSR 具有成本低、周期短、与功能基因关联性强等特 江珧属(Atrina ) ，俗称“土杯” 、“马蹄” 、“骚蛤蜊”等， 点而被广泛应用。在海洋双壳贝类中，EST-SSR 标记 广泛分布于温、热带近海海域，为海产底栖贝类，具 的开发和应用已在泥蚶(Tegillarca granosa)(董迎辉 有较高经济价值(王如才等, 2008) 。近年来，栉江珧 等, 2013)、文蛤(Meretrix meretrix) (齐晓艳等, 2013)、 遭遇生存环境的破坏和过度捕捞，出现资源量下降、 蛤 仔 (Ruditapes variegata)( 闫 路 路 等 , 2015) 、 缢 蛏 种质资源退化和遗传多样性降低等问题，