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十、變方分析(Analysis of Variance) 劉仁沛 教授 國立台灣大學農藝學研究所生物統計組 國家衛生研究院生物統計與生物資訊組 jpliu@ntu.edu.tw 變方分析(Analysis of Variance) F分配(F-Distribution) 變異數同質性之檢定(Homogeneity of Variance) 單項變方分析(One-way Analysis of Variance) 完全隨機設計(Completely Randomized Design) 容許區間(Tolerance Interval) 例：痛風病人與正常人血中尿酸量之變異 例：一個試驗比較三種飼料對天竺鼠體重 之影響 12隻天竺鼠隨機指派食用三種飼料(４隻飼料Ａ；４隻飼料Ｂ；４之飼料Ｃ)，兩星期後體重增加之觀測值(g) Ｆ分佈 樣品變方（偏差平方和）之分佈→卡方分佈 兩個獨立樣品變方(或平方和)之分佈 兩個獨立卡方變數之比的分佈 →Ｆ分佈(F-Distribution) Ｆ分佈為紀念R.A. Fisher 而命名， 故稱費氏Ｆ分佈 Ｆ分佈 Ｆ為兩個卡方變數比之分佈 Ｆ有兩個自由度 分子卡方→分子自由度 分母卡方→分母自由度 P.478-482，附表7 t為標準常態變數除以卡方平方根比之變數 t自由度為n1-1 t2為分子自由度為1，分母自由度為n1-1之Ｆ分佈 Ｆ之倒數1/F亦為Ｆ分佈：分子與分母自由度互換 痛風病人與正常人尿酸量之變異 例：人工與儀器測定成年人血液中尿酸量(mg/ml) 飼料與天竺鼠2週增重(g) 飼料稱為處理組或處理(Treatment) 天竺鼠稱為試驗單位(Experimental Unit) 影響天竺鼠2週增重變異的原因(變因) 已知變因(Known Variation) 飼料品牌 未知變因(Unknown Variation) 試驗誤差(Experimental Error) 其他所有可能的原因 天竺鼠起始體重 測量誤差 試驗環境 … 單項變方分析(One-way Analysis of Variance) 飼料A第一號天竺鼠的兩週增重 兩週增重-總平均=(飼料A平均-總平均) +(兩週增重-飼料A平均) 飼料A平均-總平均=處理A與總平均之偏差 =組間變異 兩週增重-飼料A平均=飼料A第一號天竺鼠與 處理A之偏差 =處理A組內變異 (兩週增重-總平均)2和 (-1)2+ (-5)2+ 22+ (-4)2+ (-4)2+ 22+ (-2)2+ 02+ 22+ 62+ 12+ 32=120 (飼料平均-總平均)2和 (-2)2+ (-2)2+ (-2)2+ (-2)2+ (-1)2+ (-1)2+ (-1)2+ (-1)2+ 32+ 32+ 32+ 32=56 (兩週增重-飼料平均)2和 12+ (-3)2+ 42+ (-2)2+ (-3)2+ 32+ (-1)2+ (1)2+ (-1)2+ 32+ (-2)2+ 02=64 (兩週增重-總平均)2和=(飼料平均-總平均)2和+(兩週增重-飼料平均)2和 120 = 56 + 64 總平方和=組間平方和+誤差平方和 =處理平方和+誤差平方和 資料結構 處理平均： 總平均： 總樣品數： 總平方和 總(平方和)自由度 處理平方和 處理(平方和)自由度 誤差平方和 誤差自由度 總平方和=處理平方和+誤差平方和 總自由度=處理自由度+誤差自由度 SST=SSt+SSE 均方(Mean Square, MS)： 平均的平方和=平方和/自由度 處理均方：MSt=SSt/(t-1) 誤差均方：MSE=SSE/(N-t) 單項變方分析(One-way Analysis of Variance) 將上述結果整理於變方分析表 Analysis of Variance Table (ANOVA Table) 第一行為變因(Source of Variation, SOV) 例：飼料與天竺鼠兩週增重(g) ANOVA Table 例：微陣列試驗(Microarray Exp) 基因數＞1,000 試驗整體型Ⅰ誤差機率很高 ? 基因無表現?誤判有表現的機率很高 ? 必須控制試驗整體型Ⅰ誤差機率在顯著水準α之下 多重比較(Multiple Comparisons) F值顯著?處理平均值間有顯著差異，但不知哪兩個處理平均值間有顯著差異，必須進行處理間之兩兩比較 三個飼料：三個兩兩比較 A VS. B A VS. C B VS. C 多重比較(Multiple Comparisons) 個別比較型Ⅰ誤差(Comparisonwise T