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进化与未进化小球藻响应苯酚的转录组学分析
中国生物工程杂志 ChinaBiotechnology,2017,37(7):7279
DOI:10.13523/j.cb
进化与未进化小球藻响应苯酚的转录组学分析
1,2 2 1 2 2 2
周 琳 汪 靓 高 娟 赵权宇 魏 伟 孙予罕
(1上海大学生命科学学院 上海 200444 2中国科学院上海高等研究院 上海 201210)
摘要 苯酚是工业废水中典型的环境污染物。小球藻(Chlorellasp.)由于其生长快、抗逆性强,可
以有效利用废水中的酚类化合物,是最有潜力的含酚废水处理藻株。但是高浓度苯酚产生的氧
化压力会造成小球藻细胞的氧化损伤。通过实验室适应性进化已经得到了可以耐受500mg/L苯
酚的小球藻藻株(L5)。通过无参比较转录组学数据,在基因组尺度上考察了原始小球藻(L3)和
进化后小球藻对高浓度苯酚的响应差异。无参比较转录组学结果表明,进化后小球藻能够耐受
并降解高浓度苯酚是多个代谢途径整体调控的结果。相比于原始小球藻,进化后小球藻在
500mg/L苯酚浓度下对苯酚氧化胁迫的响应增强,主要体现在细胞信号转导、ABC转运蛋白、热
休克蛋白、氮代谢和三羧酸循环(TCA)等相关的转录水平明显上调。进化后小球藻通过这些响
应降低高浓度苯酚产生的氧化压力。
关键词 苯酚 转录组学 氮代谢 三羧酸循环 小球藻
中图分类号 X172
[5]
苯酚及其衍生物是石油化工和煤化工等行业排放 受并降解500~700mg/L苯酚 。研究细菌等微生物
[1] 或微藻对苯酚的生物响应有助于了解生物与环境间的
废水中的重要污染物 。含酚废水是水污染治理中的
[6]
重点之一。苯酚毒性强,具有致癌、致畸和致突变等特 相互作用,Lin 通过 qPCR和蛋白质组学研究了不动
点。近年来,微生物方法处理苯酚废水被认为是经济 杆菌Y在降解 1000mg/L的苯酚过程中的压力反应,
实用的手段。不仅见效快、成本低,而且不会产生二次 结果表明不动杆菌Y在苯酚氧化压力下,ABC转运蛋
污染。微藻是一类单细胞生物,具有分布广泛、繁殖快 白和膜受体蛋白合成增加,但是三羧酸循环和氧化磷
和适应能力强等特点,营养方式有光合自养、光合异养 酸化被抑制。ABC转运蛋白和膜受体蛋白合成以及三
和混合兼养。微藻处理含酚废水后,可将藻细胞回收 羧酸循环和氧化磷酸化等途径都是微生物对苯酚氧化
并用催化等方法转化成化学制品再利用,可以提高废 胁迫响应的体现。作为微生物的微藻也会对苯酚氧化
水处理的经济性。 胁迫做出响应,而且这种响应不仅受诸多因素的影响,
[24] 还具有藻种特异性。本研究利用无参转录组测序分析
目前,利用细菌处理苯酚废水的研究比较多 ,
对于微藻处理苯酚废水的研究相对较少。低浓度的苯 进化后小球藻和未进化小球藻在高浓度苯酚条件下对
酚可以直接被微藻作为碳源利用,并且对微藻的生长 抗苯酚氧化压力所产生的响应差异,以探讨可能的进
和油脂合成有促进作用。但是高浓度的苯酚却抑制微 化机制。
藻的生长,甚至使藻细胞受到损伤。需要说明的是这
1 材料与方法
种抑制作用因藻种而异。为提高小球藻苯酚废水的处
理能力,在之前的实验中利用实验室适应性进化强化
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