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第10章生物信息的传递(上)

DNA dependent DNA polymerase——DDDP DNA dependent RNA polymerase——DDRP RNA dependent RNA polymerase——RDRP RNA dependent DNA polymerase——RDDP 第十章 生物信息的传递(上) ——从DNA 到RNA 第1节 RNA转录合成的特点 第2节 原核生物RNA的转录过程 第3节 真核生物RNA的转录过程 第4节 原核生物RNA的转录后加工 第5节 真核生物RNA的转录后加工 第1节 RNA转录合成的特点 ◆定义:在RNA聚合酶的催化下,以一段DNA链为模板合成RNA,从而将DNA所携带的遗传信息传递给RNA的过程称为转录。 ◆以双链DNA中的一条链上的一段DNA作为模板进行转录,从而将遗传信息由DNA传递给RNA; ◆对于一个基因组来说,转录只发生在一部分基因,而每个基因的转录都受到相对独立的控制。 ◆对于不同的基因来说,其转录信息可以存在于两条不同的DNA链上。与RNA序列完全相同的那条DNA链称为有意义链(编码链),而与mRNA互补的另一条DNA链称为反意义链(模板链)。 ◆RNA转录合成时,以DNA作为模板,在RNA聚合酶的催化下,连续合成一段RNA链,各条RNA链之间无需再进行连接。 ◆合成的RNA中,如只含一个基因的遗传信息,称为单顺反子;如含有几个基因的遗传信息,则称为多顺反子。 ◆RNA转录合成时,只能以DNA分子中的某一段作为模板,故存在特定的起始位点和特定的终止位点,特定起始点和特定终止点之间的DNA链构成一个转录单位,通常由转录区和有关的调节顺序构成。 ◆转录起点:指与新生RNA链第一个核苷酸相对应的DNA链上的碱基。 ◆上游(Upstream):转录起点前面即编码链5’末端的序列 ◆下游(Downstream):转录起点后面即编码链3’末端的序列 RNA合成不同于DNA合成之处 转录是不对称的 转录是连续的且不需要引物 转录是单向性的 转录后DNA模板成分无改变 RNA合成过程中无较对作用 ◆以DNA为模板 ◆都以四种三磷酸核苷(A、U、G、C)为底物 ◆都遵循DNA与RNA之间的碱基配对原则 ◆ RNA链的延长方向是5’→3’的连续合成 ◆需要Mg2+或Mn2+离子激活 ◆能催化两个游离的NTPs之间形成磷酸二酯键(不需要引物) ◆RNA聚合酶没有核酸酶的活性,在RNA合成过程中不起较对作用。 RNA聚合酶催化的反应 ◆全 酶:α2ββ’σω ,465kD,与RNA链的起始有关 ◆核心酶:α2ββ’ω ,与RNA链的延长有关 ◆按其对α-鹅膏蕈碱敏感性而分为三种: 酵母RNA聚合酶Ⅰ和Ⅱ 启动子序列的识别 RNA转录的起始 RNA链的延伸 转录的终止 ◆启动子(promoter) 位于基因上游,与RNA聚合酶识别,结合并起始转录有关的一些DNA序列(双链)。 ◆原核生物启动子的特点: (1)DNA序列在转录起始点的5’端区(上游区) (2)-10区:TATAAT(pribnow box),牢固结合位点,解链区 (3)-35区:TTGACA(sextama box),σ因子识别位点 (4)相距16-19bp:为聚合酶提供合适的空间结构 ◆CAP位点(Catabolite Activator Protein binding site) CRP位点(cAMP receptor protein binding site ) 在启动子上游,可与CAP蛋白结合,促进RNA聚合酶与启动子区结合或诱导解链;具有反向重复序列。 ◆识别过程 全酶与DNA分子随机结合,形成松弛复合物 σ因子在DNA双链寻找启动子 σ因子识别转录起始点(-35区),促使形成 封闭复合物,并滑动到-10区 二、RNA转录的起始 ◆ RNA聚合酶全酶促使局部双链解开 ◆ “关闭”复合体转变为“开放”复合体 ◆并催化ATP或GTP与另外一个三磷酸核苷聚合,形成第一个3,5-磷酸二酯键。 三、 RNA延长 σ因子从全酶上脱离; DNA的解链和重复螺旋化; 余下的核心酶继续沿DNA链移动,连续聚合RNA。 四、终止 ◆终止子:DNA转录的终止信号序列(terminator) ◆不依赖ρ因子的终止子:内在终止子(intrinsic terminator ) 有双重对称DNA序列(dyad),富含GC,可形成茎环结构;其后DNA模板链中有一串约6个A,转录为RNA3’端的U。 大肠杆菌两类终止子的回文结构 ◆ RNA聚合酶II识别的启动子(mRNA和SnRNA) DNA序列在转录起始点的5’端区(上游区) -25~-35bp:

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