粪便微生物学检验.pdf

粪便标本常见病原菌及检验流程 一、常见病原菌 （一）原发性肠道感染 - 导致原发性肠道感染的病原菌主要为 G 杆菌，结核分枝杆菌以及金黄色葡萄球菌，G+ 杆菌中的炭疽芽孢杆菌和蜡样芽胞杆菌，厌氧菌中的大多数梭菌属细菌。其次是轮状病毒 及原虫。而真菌一般不导致原发性肠道感染，主要与参与菌群失调后的二重感染，但症状 均较重，与抗生素滥用和侵入性治疗手段相关。 能导致原发肠道感染的 G-杆菌主要有以下几类： 1．沙门菌属细菌； 2 ．志贺菌属细菌； 3 ．小肠结肠炎耶尔森菌； 4 ．致泄性大肠埃希菌：EPEC 、EIEC 、ETEC 、EAgEC 及 EHEC 几类； 5 ．弗劳地枸橼酸杆菌； 6 ．产酸克雷伯菌； 7 ．变形杆菌属细菌（食物中毒和幼儿感染性腹泻）； 8．类志贺邻单胞菌； 9 ．气单胞菌属细菌； 10．弧菌属细菌； 11．弯曲菌属细菌； 12．偶见迟缓爱德华菌。 （二）菌群失调后及二重感染 随着不同抗生素的发现与广泛应用，移植医学的发展和普及，以及血液病人和癌症病 人放疗和化疗，激素类药物的不规范应用，各种侵入性医疗手段的推广应用带来的条件感 染、全球化 HIV 感染者群体的扩散、结核病的卷土重来等等问题，使得临床在感染病病问 题的诊断和治疗上发生了一些显著的改变，那就是各种条件感染、继发感染、菌群失调及 二重感染在临床的比重越来越大，矛盾越来越突出和严重，尤其突出表现在肠道菌群的菌 群失调及二重感染问题上。而面对菌群失调和二重感染却具有和原发性肠道感染在诊断及 治疗方法上的本质性差别。 能导致菌群失调后的二重感染的病原体主要有以下几类： 1．艰难芽孢梭菌； 2 ．金黄色葡萄球菌； 3 ．念珠菌属细菌； 4 ．铜绿假单胞菌 5 ．嗜麦芽窄食单胞菌； 6 ．变形杆菌属细菌； 7 ．克雷伯菌属细菌； 8．弗劳地枸橼酸杆菌； 9 ．致泄性大肠埃希菌； 10．非结核分枝杆菌（只要导致肠系膜脓肿） 偶见轮状病毒、隐孢子虫、及新型隐球菌等。 二、检验流程 沙门氏菌、志贺氏菌、气单胞菌和邻单胞菌应作为实验室常规培养的主要感染性腹泻 病原菌。培养病原菌的种类也应结合地域情况来确定，如沿海地区可以增加弧菌常规培养。 对于耶尔森氏菌等其它腹泻病原菌，医生应结合患者临床症状、旅游记录、饮食情况等相 关病吏申请特殊检测项目，如各类致泄性大肠埃希菌；当患者出现血便且可疑食用不洁食 物，就要小心 EHEC （EHEC ）O157 ：H7 的感染了。 秋冬季，儿童(2 y 以内)腹泻多以病毒性肠炎为主，应在腹泻病毒筛选阴性之后，再考虑 做细菌培养。艾滋病患者常伴有慢性腹泻或急性腹泻，除常规培养外，还要注意隐孢子虫 等罕见致病因子的筛查，如筛查阴性还可以进行鸟分枝杆菌复合群的染色和培养鉴定。 气单胞菌引起的水样腹泻与饮用不洁水有关。如果病人病史或临床症状提示水源性感染 则考虑气单胞菌。 邻单胞菌是引起胃肠炎的最可疑病原菌，其感染与饮用不洁水、吃生海鲜尤其是生蚝(牡 蛎)或异地旅游尤其是到美国中部或亚洲南部旅游有关。 但需要注意的是，住院 3 d 以上发生腹泻的患者进行常规培养意义不大，可以进行艰难 梭菌的培养和毒素检测。艰难梭菌毒素可引起 2 个综合征即抗生素相关性腹泻和伪膜性结 肠炎。艰难梭菌存在于健康的成人和儿童体内。当肠道微生态环境改变时艰难梭菌过度生 长，其分泌的毒素增多而致病，可进一步发展为伪膜性结肠炎，确诊要通过内窥镜检查见 到伪膜和微小脓肿。实验室能够提供伪膜性结肠炎或抗生素相关性腹泻的初步诊断。 （一）标本采集与运送： 1．送检指征 当腹泻患者出现以下任何一种情况时建议采集粪便标本，进行细菌培养：(1)粪便涂片镜 检白细胞＞5 / HP ；(2)重症腹泻；(3)体温大于 38.5 ℃；(4)血便；(5)便中有脓液；(6)未经 抗菌药物治疗的持续性腹泻患者；(7)来自疫区的患者。 2 ．标本采集 (1) 标本采集尽可能在发病早期和使用抗菌药物治疗之前。在不同的时间采集 2 ~ 3 个 标本可以提高致病菌的分离率。 (2) 自然排便