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鲂属鱼类线粒体基因组的比较及其系统发育分析_赖瑞芳
38 1 水 产 学 报
第 卷第 期 Vol. 38 ,No. 1
2014 1
年 月 Jan. ,
JOURNAL OF FISHERIES OF CHINA 2014
文章编号:1000 - 0615 (2014)01 - 0001 - 14 DOI :10. 3724 /SP. J. 1231. 2014. 48840
鲂属鱼类线粒体基因组的比较及其系统发育分析
1 1 1 1 2 1*
赖瑞芳 , 张秀杰 , 李艳和 , 吴俊颉 , 杨东辉 , 王卫民
(1. , ,
华中农业大学水产学院 农业动物遗传育种与繁育教育部重点实验室
, 430070 ;
农业部淡水生物繁育重点实验室 湖北 武汉
2. , 46400)
信阳农林学院水产科学系 河南信阳
: GenBank 、 、
摘要 基于 中团头鲂线粒体基因组全序列和三角鲂 厚颌鲂 广东鲂的部分线粒体基
, 、 3 , 4
因组序列 设计引物扩增出三角鲂 厚颌鲂和广东鲂 种鱼线粒体基因组全序列 同时对 种
。 ,4
鲂属鱼类线粒体基因组全序列进行了比较分析 结果表明 种鲂属鱼类线粒体基因组基因
, , 13 、22 tRNA 、2 rRNA 、1
排列顺序完全相同 排列紧密 均包含 个蛋白质编码基因 个 个 个非编
(D-loop ) 1 (OL )。 ND6 8 tRNA L
码控制区 区 和 个轻链复制起始区 区 除 和 个 在 链上编码
, H 。4 13 ,
外 其余的基因均在 链上编码 种鲂属线粒体基因组 个蛋白质编码基因中 均呈现出
A + T C 。 , 758 ,
较强的 偏向性和 碱基偏好 全序列比对结果显示 共有 个变异位点 其中非简约
691 , 91. 16% , 67 ,
性信息位点有 个 占总变异位点的 简约性信息位点有 个 仅占总变异位点的
8. 84% 。22 tRNA 11 , 23 , tRNA
个 基因中只有 个存在种间变异 共 个变异
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