分子连接性指数及种类.docVIP

分子连接性指数的种类 A B C 1. 陈艳，冯长君. 部分有机污染物气相色谱保留指数的QSRR研究[J]. 计算机与应用化学，200724（10）：1404～1408. 理论与方法： 距离调和指数Tc的定义和计算： 用隐氢图来表示化学结构，隐氢图中的顶点和边分别对应分子结构中的基团(或非氢原子)和化学键。用距离矩阵D描述分子中基团的连接性，设隐氢图中有n个顶点，则距离矩阵D=[dij]n×n，dij为分子结构中基团i和基团j之间最短路径上的化学键数(也称拓扑距离)。距离矩阵中每一行的矩阵元dij之和以Si表示，由此构成S矩阵。 为了区分杂原子和多重键，对拓扑距离进行修正，用相对键长取代拓扑距离。相对键长定义如下:规定C-C键的键长为1.0，以便和相邻碳原子间的拓扑距离为1一致，其它各类相邻顶点间的拓扑距离则定义为相应的键长与C-C键键长的相对值，例如:C-O键的相对键长为1.43/l.54=0.9286;C=O键的相对键长为1.22/1.54=0.7922，依次类推。以乙酸甲醋为例，其隐氢图及D矩阵和S矩阵为： 定义S矩阵中矩阵元(Si)的调和平均数的平方根为距离调和指数，用Tc表示。即： 式中“Σ”是对分子中每个原子求和，例如乙酸甲醋的Tc值为： D 1. 堵锡华，陈艳，冯长君. 连接性指数与多氯化萘理化性质的相关研究[J]. 科中技人学学报(自然科学版)，2006，36（11）：124～128. 理论与方法： 考察文献所列75种多氯化萘（PCNs）分了的结构与其正辛醇/空气分配系数1gkOA和过冷液体蒸汽压lg（pL/ Pa）的变化规律，发现PCNs的这些性质与氯原了数日及在环上的位置密切相关，为此，本文在文献方法基础上，提出一种新的原子点价值： 式中：Φi为第i个非氢原了点价，Xi为该原了的电负性（Pauling标度）；XC为碳原了的电负性值；hi为与该原了直接连接的氢原了数。式中的是对杂原了与碳原了的电负性值首先进行校正，在减去2.25的基础上（通过反复试验基础上得出的最佳值），得到杂原了相对于碳原了的电负性值，这一相对值能反映出连接在碳原了上的杂原了的电了构象，也能蕴涵分了中原了的化学环境，对于萘环上连接的氯原了点价值，考虑到不同位置的氯原了对分了的贡献有所不同，因此对式进行修正： 式中Ni表小蔡环上连接的各个氯原子的位置数。根据式可以计算得到连接在1～ 8位的氯原子的ΦCl值分别为：ΦCl1 = 12. 740，ΦCl2 = 13. 347，ΦCl3=13. 953，ΦCl4=14. 560，ΦCl5=15. 167，ΦCl6=15. 773，ΦCl7 = 16. 380，ΦCl8 = 16. 987。 E F G H I J K L O P 5. 彭国文,肖方竹,聂长明.烷氧基氯硅烷类化合物气相色谱保留指数与结构关系研究[J]. 南华大学学报(自然科学版)，2007,21（3）：6～9. 理论与方法： 对于由n个顶点构成的分子图,其距离矩阵是一个n×n对称矩阵，本文提出的一组拓扑指数来源于距离矩阵，定义为： 其中n为分子隐氢图中的原子数。 由于化合物的性质因成键原子的支化度不同而不同。因此本文考虑到在距离矩阵D中第一列增加各原子支化度参数Bi，Bi按下式定义： Bi=Zi-hi+1 式中Zi表示与分子中原子i的核外价电子数，hi表示与原子i相连的氢原子数。考虑到烷氧基氯硅烷化合物类的中心原子Si的特殊性，其支化度定义为Bsi=Zsi-hi+3 同时我们考虑用分子中原子i的平衡电负性对分子图的顶点着色,在距离矩阵D的第二列再增加各原子的平衡电负性的开方的倒数得： 其中ei=，xi表示原子i的平衡电负性。然后对Qm作如下处理： M =Qm× 其中为Qm的转置矩阵,则新的拓扑指数NPm定义为： NPm=ln(λi,m) 其中λi,m为矩阵M的特征值之和。由于随着原子边间距的增加,原子的相互作用越来越小，一般取m =1，2，3的一组拓扑指数NP1、NP2、NP3即能较好的表征分子的结构信息，因此式中m取1，2，3。例如甲烷氧基三氯硅烷的隐氢图及 增广矩阵为： 可得到甲烷氧基三氯硅烷的NP1、NP2和NP3值分别为5.724 1，5.864 1，5.858 4。我们用上述方法对烷氧基氯硅烷类化合物进行了计算。 Q R S 1. 舒元梯. 氯代苯生物活性的分子拓扑研究[J]. 达县师范高等专科学校学报，2006，16（）：～. （3） 式（3）中，δi为第i原子的点价，xP为i原子的pauling电负性值，hi为i原子直接键连的成σ键的氢原子数目，σi为i原子成σ键的电子数，np为i原子在形成离域π键时所提供的Pz电子数，3.98为氟元素的Pauli