半翅目昆虫线粒体基因组学研究进展_郭仲龙.pdf

中国科学: 生命科学 2016 年 第46 卷 第2 期: 151 ~ 166 《中国科学 》杂志社 SCIENTIA SINICA Vitae SCIENCE CHINA PRESS 评 述 半翅目昆虫线粒体基因组学研究进展 郭仲龙, 袁明龙* 草地农业生态系统国家重点实验室, 兰州大学草地农业科技学院, 兰州 730020 * 联系人, E-mail: yuanml@ 收稿日期: 2015-09-30; 接受日期: 2015-11-03; 网络版发表日期: 2016-01-15 长江学者和创新团队发展计划(批准号: IRT13019)、高等学校博士学科点专项科研基金(批准号: 20120211120043)和兰州大学大学生创新 创业行动计划项目(批准号: 20141073001011 和20151073001013)资助 摘要 线粒体基因组广泛应用于昆虫系统发育、分子进化、种群遗传学及谱系地理学等众多研究领域. 半翅 目是昆虫纲外翅部中最大的一个目, 具有重要的经济意义. 目前, 已对100 种半翅目昆虫进行了线粒体基因组测 序, 其中 81 种在中国完成测序. 本文综述了半翅目昆虫线粒体基因学研究的已有成果, 比较分析了半翅目昆虫 线粒体基因组的基本特征, 包括基因组大小、基因含量、基因重排、碱基组成、密码子使用、蛋白质编码基因 的进化模式、RNA 基因及非编码区, 并系统总结了线粒体基因组数据在半翅目昆虫系统进化研究中的应用现状. 最后, 针对线粒体基因组的获得、注释和应用过程中存在的问题进行了讨论, 并提出了今后半翅目昆虫线粒体基 因组学的研究重点. 关键词 半翅目, 异翅亚目, 线粒体基因组, 基因重排, 分子进化, 系统发育 半翅目(Hemiptera)属于节肢动物门(Arthropoda) 常多样化, 其中大部分种类为植食性, 是重要的农牧 昆虫纲(Insecta), 是有翅亚纲(Pterygota) 外翅总目 业害虫, 如蚜虫(aphids)[5,6]和盲蝽蟓(mirids)[7,8]. 部分 (Exopterygota) 中最大的一个目. 全世界已知半翅目 类群为肉食性, 如猎蝽(assassin bugs) 、姬蝽(damsel 昆虫的数量超过6 万种, 分属于约 133 个科[1]. 目前, bugs)和花蝽(flower bugs)等均为天敌昆虫, 是具有较 国际上普遍认同将过去的同翅目(Homoptera)与半翅 好利用前景的生物防治资源. 此外, 还有极少数种类 [2] 为寄生性昆虫, 如臭虫科(Cimicidae) 以及引发被称为 目合并为一个广义的半翅目 , 并分为头喙亚目(Au- chenorrhyncha) 、鞘喙亚目(Coleorrhyncha)、异翅亚目 “美洲新艾滋病” 的查加斯病(Chagas disease) 的锥蝽 (Heteroptera)和胸喙亚目(Sternorrhyncha)等4 个亚目. 亚科(Triatominae) 昆虫[9]. 其中, 异翅亚目的种类最多, 已知 4 万余种[3]. 鞘喙 昆虫线粒体基因组是一个共价闭合的环状双链 亚目的种类最少, 仅有一个鞘喙蝽科(Peloridiidae) 的 DNA 分子, 长度通常为15~18 kb, 并编码37 个基因, 32 个种, 且所有种类均孑遗于澳大利亚大陆和南美 包括 13 个蛋白质编码基因, 2 个核糖体 RNA 基因 大陆[4]. 半翅目昆虫具有显著的形态学特征, 如口器 (rRNA)和22 个转运基因RNA(tRNA)[10,11]