第2节 肽.pdf

3.2 肽 Peptide •肽 Peptide: • 由两个以上氨 基酸通过肽键 （酰胺键）连 接起来的化合 物，即氨基酸 的线性聚合物 1 二肽dipeptide：2 amino acid residues 寡肽oligopeptide ：2~20 amino acid residues 多肽polypeptide ： 20 amino acid residues 蛋白质protein ：molecular weight 10 Kd 1 2 肽链中AA的排列顺序和命名 在多肽链中，氨基酸残基按一定的顺序排列， 这种排列顺序称为氨基酸顺序(Amino acid sequence) 。 3 •通常在多肽链的一端含有一个游离的-氨基， 称为氨基端或N-端（amino-terminal or N- terminal) ； • 在另一端含有一个游离的-羧基，称为羧基端 或C-端（carboxyl-terminal or C-terminal); • 氨基酸的顺序是从N-端的氨基酸残基开始，以 C-端氨基酸残基为结束的排列顺序。 • 如上述五肽可表示为： Ser-Gly-Tyr-Ala-Leu or S-G- Y-A-L 1 4 一、肽键（Peptide bond ） 一个Aa的COOH 与另一个Aa的 NH 之间失水形 2 成的酰胺键称 为肽键。 1 5 多肽中肽键有5个特点 （1）肽键中氮原子上的 孤对电子与羰基具有明 显的共轭作用。 （2）肽键中的C-N键具有 部分双键性质，不能自 由旋转。 （C-N单键键 长0.148nm、 C=N双键 键长0.127nm、肽键键 长0.133nm） 1 6 （3）组成肽键的原子处于同一平 面，此刚性结构的平面叫肽平 面 （peptide plane ） ，或酰胺 平面 （amide plane ）。 1 7 Φ : C -N单键的旋转角度 α Ψ : C -C单键的旋转角度 α 二面角(构象角) :Φ和Ψ这2个构象角决定了相 邻2个肽平面在空间上的相对位置 1 8 多肽链的主链由许多酰胺平面组成，平面 之间以α碳原子相隔。 ψ和φ这一对二面角决定了相邻两个酰胺 平面的相对位置，也就决定了肽链的构象。 1 9 （4）二面角所决 定的构象能否存 在，主要取决于 两个相邻肽单位 中，非键合原子 之间的接近有无 阻碍。 1