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OR值的意义和计算公式，和95%?CI ? (2008-11-18 09:04:51)  HYPERLINK javascript:; 转载▼ 标签：?  HYPERLINK /?c=blogq=%D4%D3%CC%B8by=tag \t _blank 杂谈分类：? HYPERLINK /s/articlelist_1257500882_6_1.html \t _blank 统计遗传概念OR值的全称是odd ratio, 又称比值比，对于发病率很低的疾病来说，它是OR值即是相对危险度的精确估计值。 计算公式如下： Odd ratio, 95% CI 假定我们要鉴别一个基因（或者标记位点SNP）有两个等位基因（等位）:记为 Allele 1Allele 2? ? ? ?Allele 1Allele 2病例AB对照CD? odds 值在病例和对照可以计算如下： 病例Allele 1?Odds??=?A (A + B)/?B (A + B)?=?A?/?B 对照Allele 1?Odds??=?C (C + D)?/?D (C + D)?=?C?/?D?? ? 那么在这一点Allele 1的OR值可以计算如下： ????Odds Ratio =?(A / B)/(C / D)?=?A D/?B C 同样的，95% Confidence Intervals (CIs) 值可以计算如下： 95% CI of ln(OR) = ln(OR)±1.96(1/A?+?1/B?+?1/C?+?1/D)0.5 95% CI of OR = e95% CI of ln(OR)、 ? logistic回归中，OR值=1，表示该因素对疾病的发生不起作用????????????????????OR值大于1，表示该因素是一个危险因素????????????????????OR值小于1，表示该因素是一个保护因素 ??????同时最好要算出它的95%CI ??????OR为比值比，也称优势比??????当我们已知疾病的发生状况，比较疾病组与非疾病组危险因素暴露的情况差异时（即回顾性研究时），用OR进行定量描述。OR是否有意义还要看其P值，一般95%CI 上限小于1时说明可能是保护因素，相反如果下限大于1则说明可能是危险因素。 ln(OR)近似服从正态分布，因此在计算OR值置信区间的时候都是先计算ln(OR)置信区间，再计算OR置信区间（参考：/pmc/articles/PMC1127651/， /bt/products/bio_epi/scripts/mod12.pdf，/faculty/gerstman/StatPrimer/case-control.pdf） 参考资料1（维基）： HYPERLINK /wiki/Odds_ratio /wiki/Odds_ratio# 定义：Definition in terms of group-wise odds If the probabilities of the event in each of the groups are?p1?(first group) and?p2?(second group), then the odds ratio is: where?qx?=?1???px. An odds ratio of 1 indicates that the condition or event under study is equally likely to occur in both groups. 参考资料2： HYPERLINK /snp-tools-excel/ /snp-tools-excel/ 例子1： 例子2： 参考资料3：blackwell出版社  HYPERLINK /specialarticles/jcn_10_268.pdf /specialarticles/jcn_10_268.pdf 参考资料4： HYPERLINK /ebmreviews/odds.html /ebmreviews/odds.html 参考资料5： HYPERLINK /scehsc/pdfs/D-1-3-3%20lesson%20calculating%20odds.pdf /scehsc/pdfs/D-1-3-3 lesson calculating odds.pdf 参考资料6?： HYPERLINK /class/gene210/files/writeups/gwas-howto-2.pdf /class/gene210/files/writeups/gwas-howto-2.pdf 参考资料7:??/he