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喀斯特原生土壤与退化生态系统土壤细菌群落结构-应用生态学报
应 用 生 态 学 报# ( 年% 月# 第 卷# 第% 期# # # # # # # # # # # # # # # # # # # # # # # # # # # # #
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喀斯特原生土壤与退化生态系统土壤
细菌群落结构!
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陈香碧 # 苏以荣 # 何寻阳# 魏文学# 魏亚伟 # 代晓燕
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(中国科学院亚热带农业生态研究所亚热带农业生态重点实验室,长沙% !!’ ; 中国科学院研究生院,北京 !%( ; 华
中农业大学资源环境学院,武汉%$) )
摘# 要# 运用*+,-,./* 技术,对桂西北喀斯特原生土壤和退化生态系统土壤细菌!01 2345
基因多样性及系统发育关系进行了研究6 结果表明:原生土壤比退化生态系统土壤具有更丰
富的!01 2345 基因型和更高的多样性指数,两样地共有的基因型仅有 个6 从每种基因型中
随机选择一个克隆子作为代表进行测序分析,所有序列与789:;9 数据库中序列的同源性为
=) ? ! ,且两样地中均有超过一半的基因型序列与数据库中已知序列同源性低于() ,
属于分类在“种”地位上的新发现细菌;通过系统发育研究将两样地的细菌分为! 大类群,两
样地共同拥有’ 大类群,但两样地的细菌优势类群明显不同,原生土壤为!#$%#’($%)’ ,含$(
种基因型,占总克隆子数的’=@ ,退化生态系统土壤为*()+#’($%)’ 和!#$%#’($%)’ ,分别
含!( 种和!’ 种基因型,占总克隆子数的$@ ’ 和$@ ’ ;与原生土壤细菌类群相比,退化生
态系统土壤!#$%#’($%)’ 类群明显减少,*()+#’($%)’ 类群明显增加6 土壤理化性质及土壤环
境因素的差异是引起两类型土壤细菌多样性差异的原因6
关键词# 喀斯特# !01 2345# 细菌多样性# 基因型# *+,-,./*# 系统发育
文章编号# ! !A($$ (( )% A=0$A(# 中图分类号# B($=6 !# 文献标识码# 5
!#$ %’()*#$ ’++,-#(. /(*,’(,*) #- 0*#+)1$ 2*)/( -3 3)4*3)3 )’/./()+ #- 5*/( *)6
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