N_糖肽的规模化质谱解析方法进展_曾文锋.pdf

ReviewsandMonographs综述与专论 生物化学与生物物理进展 Progress in Biochemistry and Biophysics 2016, 43(6): 550~562 N-糖肽的规模化质谱解析方法进展* 1, 2) 3) 3) 1, 2) 1, 2) 1, 2) 曾文锋 张 扬 刘铭琪 吴建强 张晓今 杨 皓 ) ) , 2) ) ) , 2)** 超1 浩1 昆1 1 3 1 刘 迟 张 孙瑞祥 杨芃原 贺思敏 1 ( ) 中国科学院智能信息处理重点实验室，中国科学院计算技术研究所，北京100190； 2) 3) 中国科学院大学，北京100049； 复旦大学生物医学研究院，上海200032) 摘要 蛋白质糖基化修饰的鉴定是蛋白质翻译后修饰分析中最具挑战性的任务之一，近几年尤其受到关注．快速发展的质谱 技术为规模化的蛋白质糖基化修饰研究提供了有效的手段．与其他基于质谱技术的翻译后修饰鉴定相比，糖基化鉴定的难点 在于糖链是大分子而且存在微观不均一性，另外糖链本身可以在串联质谱中碎裂且与肽段的碎裂规律不同，导致蛋白质组学 的质谱解析方法和软件难以完整地鉴定肽段序列和糖链结构．完整N- 糖肽的鉴定是糖基化分析的热点内容之一，针对N- 糖 肽的鉴定，近年来，人们开发了多种多样的质谱解析方法，其中包括用N- 糖酰胺酶切除糖链后鉴定N- 糖基化位点的方法、 基于电子转运裂解的糖肽肽段鉴定、基于高能碰撞裂解与电子转运裂解联用或碰撞诱导裂解与三级谱联用的完整N- 糖肽鉴 定等等．本文对这些质谱解析方法进行了整理和综述，简要指出了目前完整糖肽鉴定软件存在的一些不足，展望了未来的发 展方向． 关键词 糖蛋白质组学，糖肽，糖基化，质谱 学科分类号 Q51 ，TP39 DOI: 10.16476/j.pibb.2015.0402 蛋白质的糖基化修饰是最常见、最重要的蛋白 结[11-15]． 质翻译后修饰之一，它在蛋白质折叠、寄主病原相 作为最主要的蛋白质糖基化修饰之一，N- 糖 互作用等生命活动中起到了关键作用，而且糖蛋白 基化是糖基化修饰分析的热点内容．N- 糖基化修 也是主要的药物作用靶点和临床标志物之一[1-2] ． 饰主要发生在氨基酸序列模体 “天冬酰胺-X- 丝氨 糖蛋白的质谱分析可以追溯到1978 年，Morris 等[3] 酸/ 苏氨酸(N-X-S/T)”的天冬酰胺上，极少量发生 利用电子碰撞(EI)和化学电离(CI)技术，并结合埃 在 “天冬酰胺-X- 半胱氨酸(N-X-C)” 的天冬酰胺 德曼降解方法，分析出了一种南极鱼类的某些抗冻 上(其中X 可以是除脯氨酸以外的任意氨基酸) ．与 糖蛋白．早期的糖蛋白质谱鉴定方法的历史脉络可 天冬酰胺相连接的糖链以五糖核心为基础，一般有 以参考前人的综述[4-9] ．随着蛋白质组学分析技术 三种糖型：高甘露糖、混合型和复杂型． 目前基于 和计算技术的发展，尤其是串联质谱技术的快速发 质谱技术的糖蛋白质组学是沿袭自鸟枪法蛋白质组 展，人们开始关注糖蛋白的组学分析，因此出现了 蛋白质组学的子领域—— 蛋白质组学[9] 蛋白