不同长度的多肽链在疏水表面上自组装的分子动力学模拟.pdfVIP

摘要 许多不同序列的蛋白质或多肽链在病理性条件下会自组织形成淀粉样纤维聚集体， 其组成结构主要是β-折叠。这些不溶于水的淀粉样纤维沉积在神经元细胞之间或表面上 会引发一些神经性疾病，如帕金森氏症、朊病毒、老年痴呆症等。然而，蛋白质或多肽 链自组装形成的这种有序纤维结构却有着良好的弹性和强度，可以与蛛丝相媲美。因此， 研究蛋白质或多肽链的自组装机理对解决人类疾病和开发设计新型生物材料有着重要 意义。在本论文课题研究中，我们采用分子动力学模拟技术研究了不同长度的带疏水侧 链的聚丙氨酸多肽链(polyalanines)分别在纯水中和疏水表面上自组装的行为机制，其中 疏水表面是由有机小分子 HS-(CH ) -CH 自组织形成的单分子层(self- assembled 2 11 3 monolayer) 。根据模拟得到的结果发现，在水溶液中，聚丙氨酸多肽链形成 β 结构的增 长速度是以指数形式衰减的；而在疏水表面上，它们能够较快速地形成β 结构，整个生 长过程由两部分组成，每部分都是线形生长模式，即 β 结构的生长速度是保持恒定的。 此外，我们研究了疏水表面对多肽链构象的影响，发现多肽