不同生长时期梅花鹿鹿茸转录组分析.pdfVIP

畜牧兽医学报2017，48(2)：235—242 Ac￡a耽feri，z口ri口P￡Zoo￡Pc矗咒ic以Si咒if口 doi：10．11843／j．issn．0366—6964．2017．02．006 不同生长时期梅花鹿鹿茸转录组分析 张然然，刘华淼，王 磊，邢秀梅+，苏伟林，高 兵 (中国农业科学院特产研究所特种经济动物分子生物重点实验室，长春130112) 摘要：本研究旨在探究不同生长时期梅花鹿鹿茸的转录组差异，丰富梅花鹿鹿茸转录组信息。选取5个生长时 期(10、20、28、44、66d)的梅花鹿鹿茸组织作为试验样品，利用111uminaHiSeq7”2500高通量测序，并用测序评估、 基因注释等生物信息学方法进行分析。结果，经过测序、转录本拼接获得了375657条contigs，平均长度为688 bp，329946个unigenes，平均长度为534 据库，90．07％unigenes得到了成功注释。其中39674个(12．02％)基因成功注释到G0数据库，在level2水平上 共分为41个类别；17732个(5．37％)基因成功注释到将KOG的26个类别中。对5个生长时期的鹿茸转录本文 库进行比较分析，共发现了509个差异基因，其中407个差异表达基因成功注释到G0数据库中，主要为信号转导、 氧化还原、转录调节、蛋白酶降解等生物学过程。其中转录调节基因PERl、EGRl的表达随着鹿茸的生长而增加， 的调节作用。本研究利用高通量测序技术对不同生长时期的梅花鹿鹿茸组织进行了转录组测序和分析，筛选到了 梅花鹿鹿茸在不同生长时期下的差异表达基因，并获得了差异表达基因的功能。 关键词：梅花鹿；鹿茸；转录组；差异表达基因 中图分类号：S825；S813．1文献标志码：A 文章编号：0366—6964(2017)02～0235一08 ofSikaDeerAntlersatDifferent TranscriptomeAnalysis Stages H ZHANGRan—ran，LIUua—miao，WANGLei，XINGXiu—mei+，SUWei_lin，GAO Bing (S￡n￡P Efo咒07规icA咒imnZMoZef“Znr A咒i优口Z KPyL口60，‘nforyo，Sp已fi口Z BioZogy，I咒s￡if乱￡Po厂SpPci以Z 口托dPZn，zfScig规cPs o厂(冼i咒PsPAc口demyo厂Agric“Z￡MrnZ ectiveofthis wastofindthe differencesofsikadeerantlers Abstract：The obj study transcriptome atdifferent enrichthesikadeerantler data．Thesikadeerantlers stages，and transcriptome aged and66dwereselectedas material，thenthe 1ibrariesof 10，20，28，44 experimental transcriptome antlerswereconstructed11lumina 2500 andthe data byusing HiSeqTMplatform， transcriptome were bioinforma