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青藏高原小柴旦盐湖微生物群落结构及多样性.PDF
第38卷第5期 水 生 态 学 杂志 Vol.38,No.5
2017年 9月 JournalofHydroecology Sep. 2017
DOI:10.15928/j.1674-3075.2017.05.008
青藏高原小柴旦盐湖微生物群落结构及多样性
1,2 1 1 3 1 1
刘 静 ,张 欣 ,沈国平 ,封希媛 ,龙启福 ,朱德锐
(1.青海大学医学院基础医学研究中心,西宁 810016;
2.北京工业大学计算机学院,北京 100022;3.青海民族大学,西宁 810016)
摘要:通过探究小柴旦盐湖微生物群落结构与多样性,为盐湖微生物资源的开发利用和生态保护提供重要的理论
参考依据。利用IlluminaMiSeq测序平台对小柴旦盐湖细菌和古菌的16SrRNA基因(V3~V5区)进行高通量测
序,获得细菌和古菌的物种注释OTU(OperationalTaxonomicUnits)数目分别为870和410,其中分类地位明确的
细菌有18门、24纲、135属,古菌2门、4纲、22属。细菌优势类群依次是厚壁菌门(Firmicutes,34.05%)、变形菌
门(Proteobacteria,32.91%)、拟杆菌门(Bacteroidetes,18.01%)和蓝细菌门(Cyanobacteria,8.46%);优势种群依次
是芽孢杆菌属(Bacillus,21.53%)、Chloroplastnorank(6.65%)和海杆菌属(Marinobacter,4.05%)。古菌的优势类
群和优势种群主要是未确定分类地位的沃斯古菌门(WoesearchaeotaDHVEG6,80.84%),相关的系统分类学尚
需深入研究。小柴旦盐湖微生物的种群结构复杂、类群丰富,细菌Shannon多样性指数(4.77±0.45)显著高于古
菌(2.79±0.45),且存在大量的新种资源。
关键词:小柴旦盐湖;高通量测序;微生物多样性;种群结构;聚类分析
中图分类号:Q145 文献标志码:A 文章编号:1674-3075(2017)05-0055-10
青藏高原柴达木盆地湖泊资源丰富,分布着地 菌素、抗生素、相容溶质和抗肿瘤活性物质)等不同
6 2
球上面积最大(2×10km)、海拔最高(平均4500 2007;朱德锐等,2012;
方面的相关研究(魏有霞等,
m以上)、数量最多(>50个)及以盐碱湖集中为特 赵婉雨等,2013;时玉等,2014;王鑫,2014)。至此,
色的高原湖群区。高原盐湖是陆地生态系统的重要 在全球气候变化条件下,研究青藏高原湖泊的微生
组成部分,地处内陆干旱或半干旱地区,这些特殊的 物多样性,对环境监测、生态保护和地域资源开发具
地理环境蕴含着丰富的微生物资源,是宝贵的生物 有重要的指示意义。
种质资源库,为科学研究提供了天然的实验材料。 环境微生物多样性反映群落生态组成的主要特
高原极端盐湖水体中栖息大量独特的嗜盐细菌和古 征,也是环境优劣评估的重要指标(李红晓等,
菌,它们是陆地生态系统的重要参与者,具有丰富的 2016)。目前,环境微生物多样性的研究方法有选
物种和遗传多样性,存在极为特殊的生理结构和代 择分离培养、BIOLOG生理指纹、磷脂或脂肪酸生物
谢机制,并以高度的变异性适应不同环境,同时在盐 标记(PLFA或 WCFAFAME)、分子标记(SRAP、
湖生态系统的物质循环与能量流动、生态系统的演 AFLP及 TRFLP)、16SrRNA 基 因指纹 图谱
替以及
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