普通烟草cesa基因家族成员的鉴定亚细胞定位及表达分析-遗传.pdfVIP

Hereditas (Beijing) 2017 年 6 月, 39(6): 512 ―524 研究报告 普通烟草CESA 基因家族成员的鉴定、亚细胞定位 及表达分析 1,2 1 徐宗昌 ，孔英珍 1. 中国农业科学院烟草研究所，中国农业科学院烟草遗传改良与生物技术重点开放实验室，青岛 266101 ； 2. 中国农业科学院研究生院，北京 100081 摘要 : 纤维素合成酶蛋白(cellulose-synthase proteins, CESA)是一类质膜定位蛋白，以蛋白复合体的形式存在于 质膜上合成纤维素，在细胞壁建成和植物生长发育过程中起着非常重要的作用。本研究利用CESA 蛋白保守域 序列PF03552 检索普通烟草(Nicotiana tabacum L.)蛋白序列，并通过拟南芥(Arabidopsis thaliana ) 10 个CESA 蛋 白序列在普通烟草基因组数据库中利用TBLASTN 程序进行比对，共获得 21 条NtCESA 基因候选序列，对这 些序列进行蛋白序列理化性质分析、系统进化树构建、基因结构分析、保守结构域及跨膜区分析和组织表达模 式分析，并对NtCESA9 和NtCESA14 两个蛋白进行了亚细胞定位实验。结果表明：获得的21 条NtCESA 蛋白 序列的理化性质相似；系统进化分析将21 个NtCESA 基因和 10 个AtCESA 基因分成 5 个分支，每一个分支各 成员之间的进化相对保守，基因结构类似，不同分支之间的基因结构差异也较小；NtCESA 蛋白结构域相对保 守，都含有CESA 蛋白典型的N 端锌指结构、C 端跨膜区和DDD-QXXRW 保守功能域；组织表达分析结果表 明，大部分NtCESA 基因在幼苗和成熟期烟草的根、叶、胚芽和愈伤组织中都有表达，同一个分支中的基因表 达模式基本一致，并且NtCESA 基因参与初/ 次生细胞壁纤维素的合成与该基因编码蛋白的跨膜区数目存在关联， 表明NtCESA 基因家族成员功能上的复杂性；亚细胞定位结果证实NtCESA9 和NtCESA14 为质膜定位蛋白。 本研究为烟草CESA 基因家族功能的深入研究奠定了基础。 关键词 : 普通烟草；CESA 基因家族；基因表达；亚细胞定位 Genome-wide identification, subcellular localization and gene expression analysis of the members of CESA gene family in common tobacco (Nicotiana tabacum L.) Zongchang Xu 1,2, Yingzhen Kong1 1. Key Laboratory of Tobacco Genetic Improvement and Biotechnology, Tobacco Research Institute of Chinese Academy of Agri- cultural Sciences, Qingdao 266101 , China; 收稿日期: 2017−02−09; 修回日期: 2017−04−14 基金项目: 国家科技支撑计划项目(编号：2015BAD15B03-05)和国家自然科学基金项目(编号 资助[Supported by the National Key Technology RD Program (No.2015BAD15B03 -05), and the National Natural Science Foundation of China (Nos ] 作者简介: 徐宗昌，在读博士研究生，研究方向：作物遗传育种。E-mial : xuzc1110@163.com 通讯作者: 孔英珍，研究员，博士生导师，研究方向：细胞壁多糖合成。E-mial : kongyingzhen@ DOI: 10.16288/j.yczz.16-428 网络出版时间: 2017/5/3 16:40:05 URI: /kcms/detail/11.1913.R1640.002.html 第6 期 徐宗昌等: 普通烟草CESA 基因家族成员的鉴定