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2018-08-19 发布于天津
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元锡轻工大学学报-食品与生物技术学报.pdf

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元锡轻工大学学报-食品与生物技术学报

。第24卷第1期无锡轻工大学学报 V01．24No．1 2005年1月 ofWuxi of Jan． 2005 Journal UniversityLightIndustry 文章编号：1009-038X(2005)01-0084—05 基于神经网络的多聚脯氨酸二型结构预测陆克中，黄可望，须文波 (江南大学信息工程学院，江苏无锡214036) 摘要：使用“机器学习方法”对稀有的多聚脯氨酸二型(PPII)的二级结构进行预测，在预处理蛋白质序列的基础上，使用生物信息学中常用的BP神经网络预测PPII二级结构．通过对不同输入窗口长度与不同隐层节点数的神经网络进行训练和测试，得出在输入窗口长度为13个氨基酸残基和隐节点数为15时预测效果最好，此时的预测精度可达73．8％．关键词：神经网络；BP一模型；蛋白质二级结构；多聚脯氨酸二型结构预测；多聚脯氨酸二型结构中图分类号：Q61 文献标识码：A of II Structures Prediction PolyprolineTypeSecondary byArtificialNeuralNetwork LU Wen—bo Ke-zhong，HUANGKe—wang，XU ofInformation 214036，China) (School University，Wuxi Technology，SouthernYangtze farfewworkshavebeenconductedto Abstract：So polyprolinetype predict structurewithmachine thebaseof proteinsequences，this learningapproaches．Onpreprocessing BP modelthatismost PPII structurewith neuralnetwork paperpredictssecondary type’S usedin and neuralnetworkswithdifferentwindow bioinformatics．Bytesting frequently training anddifferenthidden couldbeconcluded best resultwas rengths nodes，it that，thepredicting 1 the hiddennodewas1 obtainedwhenthewlndowwas3 and the