基因组序列资讯分析-生物产业自动化教学及研究中心
生物信息學
1 概述
當前人類基因組研究已進入一個重要時期,2000年將獲得人類基因組的全部序列,這是基因組研究的轉捩點和關鍵時刻,意味著人類基因組的研究將全面進入資訊提取和資料分析階段,即生物資訊學發揮重要作用的階段。到1999年12月15日發佈的第115版爲止,GenBank中的DNA堿基數目已達46億5千萬,DNA序列數目達到535萬;其中EST序列超過339萬條; UniGene的數目已達到7萬個;已有25個模式生物的完整基因組被測序完成,另外的70個模式生物基因組正在測序當中;到2000年1月28日爲止,人類基因組已有16%的序列完成測定,另外37.7%的序列已經初步完成;同時功能基因組和蛋白質組的大量資料已開始湧現。如何分析這些資料,從中獲得生物結構、功能的相關資訊是基因組研究取得成果的決定性步驟。
生物資訊學是在此背景下發展起來的綜合運用生物學、數學、物理學、資訊科學以及電腦科學等諸多學科的理論方法的嶄新交叉學科。生物資訊學是內涵非常豐富的學科,其核心是基因組資訊學,包括基因組資訊的獲取、處理、存儲、分配和解釋。基因組資訊學的關鍵是“讀懂”基因組的核苷酸順序,即全部基因在染色體上的確切位置以及各DNA片段的功能;同時在發現了新基因資訊之後進行蛋白質空間結構類比和預測,然後依據特定蛋白質的功能進行藥物設計。瞭解基因表達的調控機理也是生物資訊學的重要內容,根據生物分子在
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