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00000第五章 蛋白质结构解析 X射线晶体结构分析
5、模型的建立和修正 X-射线晶体衍射法的发展 无论从结构测定的方法还是从结构测定所用的仪器都有了飞跃的发展。第三代同步辐射光源的应用使得用20-40 um大小的晶体解析高分辨率结构已经成为现实。 目前世界上比较著名的同步辐射工作站有多个: APS(USA); ESRF(France); SPring-8(Japan) 思考题 X射线衍射现象的产生机制。 常用的蛋白质结晶的方法。 解决位相问题的几种重要方法。 推出了著名的布拉格方程.布拉格父子开创了父子同获诺贝尔奖的先例,同时,小布拉格获诺贝尔奖时才25岁,至今还保持着诺贝尔奖获得者中获奖年龄最轻的纪录。 在《Nature》上发表了SIV-MA的晶体结构,首次提出HIV及其家族分子的装配模型;在《Cell》上发表了H Factor Ⅸ EGF-like Domain与Ca++结合复合物的结构与功能研究结果,揭示了该复合物的生物学机理;在2003年SARS爆发期间,成功地解析出第一个SARS病毒的蛋白质-3CLPRO及其与抑制剂复合物的晶体结构,为抗SARS药物的发现奠定了重要的结构基础,论文在《PNAS》上发表。其研究组已经系统地表达出200余个与人类健康密切相关的重要蛋白质,解析出50多个重要蛋白质的结构。 在《Nature》上发表文章报道了流感病毒中某种酶的活性部位的结构与功能,为抗流感新药的设计提供了思路。 天文学家要探测宇宙星球,可以选用无线电波;航空管理者要跟踪飞机,可以选用微波(雷达) 20世纪60年代末出现的同步辐射光源,是被誉为“神奇的光”的又一种人工光源 .上海同步辐射装置( Shanghai Synchrotron Radiation Facility,简称 SSRF),是一台世界先进的中能第三代同步辐射光源,总投资计划12亿人民币。上海同步辐射装置的电子储存环电子束能量为3.5GeV(35亿电子伏特),仅次于世界上仅有的三台高能光源(美、日、欧各一台),电磁场理论早就预言:在真空中以光速运动的相对论带电粒子在二极磁场作用下偏转时,会沿着偏转轨道切线方向发射连续谱的电磁波。1947年人类在电子同步加速器上首次观测到这种电磁波,并称其为同步辐射.第三代同步辐射光源的 X射线亮度是 X光机的上千亿倍。 王更先 面向2008级生物技术 第五章 蛋白质结构解析 概述 第一节 X射线晶体结构分析 人体基因数目仅比低等生物线虫多两倍。如此少的基因是如何创造出人体如此复杂的生命活动? 人体基因的主要功能是通过蛋白质来实现的,蛋白质扮演着构筑生命大厦的主要角色。人体中大约有10万种蛋白质。 测定蛋白质结构的意义 蛋白质三维结构解析方法 X-射线晶体衍射法:85.3% 核磁共振波谱:14.7% 电镜三维重构、各种光谱技术、显微 技术和计算机模拟 X-Ray晶体衍射目前仍然是蛋白质三维结构测定的主要方法。 优点:分辨率高,能精确确定生物大分子中各原子的坐标、键长、键角,给出生物大分子的分子结构和构型,确定活性中心的位置和结构 缺点:只能测定单晶,反映静态结构信息,无法测定溶液中的信息。 蛋白质三维结构解析过程 第一节 X-射线衍射测定蛋白质结构 一、X射线晶体结构分析发展史(了解) 二、X射线晶体结构分析基本原理(掌握) 三、蛋白质X射线晶体结构测定程序(理解) 1895年11月8日 ,德国物理学家,50岁的伦琴在自己的实验室中偶然发现 一种从阴极射线管中辐射出的新型射线,由于对管子发出的“东西”性质不确定,伦琴就把这种射线命名为“X射线” 。 威廉·康拉德·伦琴 Wilhelm Conrad R?ntgen 一、X射线晶体结构分析发展史 1901年第一届诺贝尔物理学奖评选时,29封推荐信中就有17封集中推荐他。伦琴最终获得了第一次诺贝尔物理学奖金。 诺贝尔物理奖奖章 人类第一张X光照片 1895年11月22日 伦琴妻子之手 X射线衍射 1912年Max von Laue发现X射线具有衍射的现象。(1914年的诺贝尔物理学奖) 图片出处: /nobel/netshow/nobelscience/physics/physics03.htm 劳伦斯·布拉格( Lawrence Bragg) 亨利·布拉格(Henry Bragg) X射线研究晶体结构亨利·布拉格(William Henry Bragg)和劳伦斯·布拉格(William Lawrence Bragg)父子在这方面所作出的杰出贡献 , 分享了1915年的诺贝尔物理学奖。 X射线衍射用于蛋白质结构的测定 1954年伯纳尔(Bernal)获得第一张胃蛋白酶晶体X衍射图片。 1957年肯特罗(Kendrew)完成肌红蛋白的0.6 nm分辨率的蛋白质
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