球状蛋白质分子中氨基酸紧密接触对性质的似研究.pdfVIP

第 期 高 分 子 学 报 ! K0 ! 年 月 !) $ ， J-FJ ET?‘D[;C-J .CKC-J JH7 !) 球状蛋白质分子中氨基酸紧密接触对性质的研究! 陈 进 李 靖 章林溪 姜舟婷 夏阿根 叶高翔 赵得禄 （浙江大学物理系 杭州 )(!%） （中国科学院化学研究所分子科学中心 北京 (% ） 摘 要 采用 软件（ ），对 种球状蛋白质分子中氨基酸紧密接触对（ -./ -0123425 06 5278428739 81:25 *( ;5:=8# 75:=8 4012342 ）进行了研究 重点研究了不同氨基酸在形成远程紧密接触对（ ）和近程紧密接 ?01@#731@ 4012342 触对（ ）时的不同能力 发现氨基酸 ， ， ， ， ， ， ， （疏性氨基酸，）比较容 .A072#731@ 4012342 ?8 B39 C9 D2 EA FG7 -G5 F7H I 易形成远程紧密接触对，氨基酸 ， ， ， ， ， ， ， （亲水氨基酸，）比较难形成远程紧密接触 ,98 ,91 J5H J51 ?G5 .7 J7@ E70 E 对，而氨基酸 ， ， ， （中性氨基酸，）在形成远程紧密接触对时能力一般 它们平均每个氨基酸可形 J93 ,9G FA7 I:5 K 成 ， 和 个远程紧密接触对 同时它们在形成近程紧密接触对时能力非常接近，平均每个氨基酸 * L) ) L*$ $ L$) 可形成的近程紧密接触对数目在 变化，差别非常小 亲水氨基酸（），中性氨基酸（）和疏水性氨 ! L)$ M ! L%+ E K 基酸（）在蛋白质分子结构稳定性上起着不同的作用 I 关键词 球状蛋白质，紧密接触对， 软件，折叠 -./ 球状蛋白质是一类非常普遍的蛋白质，它的 氨基酸之间如能形成氢键，这样氨基酸的相互作 特点是蛋白质分子非常紧密，内部空间的绝大部 用就非常强的，也应该算是形成紧密接触对 因此 仅仅考虑 ! ! 之间的距离是不够的 等 分被原子所充满，体系的能量来源于氨基酸与氨 - #- .0W09R 基酸的紧密接触对的作用（ ） 在研究紧密接触对时考虑了各种因素，开发了 ;5:=8#75:=8 4012342